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DNA条形码技术在麻蝇亚科鉴定中的应用.pdf

中国人兽共 患病学报 2015,31 (6) ChineseJourna1ofZoonoses 569 DOI:103969/c]z.j.issn1002—2694.2015.06016 DNA条形码技术在麻蝇亚科鉴定中的应用 方义亮 ,张建庆 ,肖 武 ,高 博 ,房长天 ,卞圮皤 ,徐保海。 摘 要 :目的 建立麻蝇亚科种类鉴定的DNA条形码技术 ,以期解决麻蝇亚科雌性个体无法通过形态鉴定 的问题 。方 法 通过对福建 口岸截获的黑尾黑麻蝇、黄须亚麻蝇、褐须亚麻蝇、棕尾别麻蝇、酱亚麻蝇等标本进行 PCR扩增和序列测定, 与 BOLD上下载 的88条麻蝇亚科蝇种序列进行 比对 ,计算遗传距离、构建系统进化树。结果 5份样本扩增获得 CO1的长度 为 658bp,在线 BLAST 比对结果显示相似度 99 以上,遗传距离计算结果显示种 内差异 0~0.0154,种 间差异 0.0249~ 0.1538,系统进化树显示麻蝇亚科 同种能聚在一块 ,Bootstrap值为 1000。结论 DNA条形码技术可 以作为麻蝇亚科蝇种 鉴定在形态学鉴定之外的重要方法补充 。 关键词 :DNA条形码 ;C0I;蝇类鉴定 中图分类号 :R384.2 文献标识码 :A 文章编号 :1002—2694(2015)06—0569—05 SarcOphaginaeidentificationbyDNA—barcoding FANG Yi—liang,ZHANGJian-qing ,XIAOWu ,GAOBo,FANGChang-tian,BIAN Qi-fan2,XU Bao~hai。 (1.FujianInternationalTravelHealthcareCenter,Fuzhou350001,China; 2.FujianMedicalUniversity,Fuzhou350004,China; 3.FujianCenterforDiseaseControlandPrevention,Fuzhou350001,China) Abstract:Inthisstudy,weaimedtoestablish methodforidentifying SarcophaginaebyDNA—barcodingandtosolvethe problem thatSareophaginaefemalespeciescouldnotbeidentifiedbymorphology.W eamplifiedandanalyzedthesequencesof thesesamples in Fujian frontiersuch asHgZc0矗ngZZ口melanura,P。rnsnrc0p 口gnmisera,Parasarcophaga sericea, Boettcheriscaperegrine,Parasarcophagabrevicornis,Parasarcophagadux,Parasarcophagasimilis,Parasarcophagaalbi— ceps,ParasarcophagaPingi,andSeniorwhiteareciproca.Secondly,wealignedthesesequenceswith88Sarcophaginaespe— ciesloadedfrom BOLD.Thirdly,weestimatedthegeneticdistancesandbuiltsystem evolutionarytree.Theresultofamplifica— tionwith5samplesshowedthatlengthoftheobtainedCOlsequenceswere658bp.AndtheresultofalignmentonBOLD line showedthatindexofsimilarityofthesamespecieswasabove99 .Theresultofcalculationgeneticdistancesshowedthatin— traspecificdiffere

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