叶冬青-复杂疾病的流行病学研究策略.pptVIP

中国第一项GWAS研究 * * * case-only study and family-based association study Replication study (call for large sample size and multi-center study) Chinese Koreans Japanese MMEL1 BLK GPR137B AIRE FCRL3 CTLA4 AFF3 CGA1 C8orf13-BLK SLC22A4 PADI4 PADI4 CCL21 PADI4 RUNX1 STAT4 STAT4 ARHGEF3 STAT4 PRDM1 PTPN2 TRHDE CD244 CDK6 FLI1 IRF5 TRAF1-C5 TRAF1-C5 TRAF1-C5 KIF5A-PIP4K2C LCP2 TNFAIP3 These findings highlighted the genetic heterogeneity of RA susceptibility between Chinese Han and other East Asian populations. GWAS是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，从而寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。 Genome-Wide Association Study（GWAS） 全基因组关联研究 中国人群麻风病的GWAS 中国人群肺癌的GWAS New susceptibility loci:ETS1, IKZF1, RASGRP3, SLC15A4, TNIP1 Confirmed:BLK, IRF5, STAT4, TNFAIP3, TNFSF4, 6q21 and 22q11.21 Han JW , et al. Nat Genet 2009 中国人群SLE的GWAS 基因-基因交互作用（Gene-gene interaction） 同一通路中或相关通路的多基因联合研究,克服单一基因多态性研究的缺陷, 便于基因基因交互研究 Gene-Gene Ref. MMEL1 + C80rf13-BLK J Rheumatol. 2011 SNP pairs within the HLA class II locus Hum Genet. 2011 TNFRSF14 +TNFRSF6B Arthritis Rheum. 2010 HTR2A + HLA-DRB1 Eur J Hum Genet. 2010 PTPN22 + HLA-DRB1 BMC Proc. 2009 SELS -105 +IL-1 Ann Rheum Dis. 2009 PTPN22 + TRAF1-C5 BMC Proc. 2009 Multiple genes BMC Proc. 2009 食管腺癌的基因-环境交互作用 Gene-environment interaction 基因-环境交互作用 能增强统计遗传学检测方法的检验效能 能更准确地估计影响复杂疾病的群体遗传效应和环境效应 能更好地揭示复杂疾病的机制，解释环境暴露是怎样影响到生物通路的功能 通过揭示环境因素的改变如何影响到生物通路的反应，可以为疾病的防治提供新的思路 基因-基因、基因-环境交互作用研究的意义 Importance of gene-gene gene-environment interaction 注重宏观与微观相结合 Comparison of miR-146a expression levels between groups of healthy individuals with different rgenotypes. Luo X, Yang W, Ye DQ, et al. PLoS Genet 2011 本课题参与的研究发现，Ets-1风险等位基因显著关联着IL-17的表达. 基因型-表达水平的关联 Genotype-expression correlation 基因型-临床表型的关联 Genotype-phenotype correlation genotype-phenotype correlation 注重宏观与微观相结合 Association study of TNIP1 rs7708392 with SLE in a Japanese population Arthritis Res Ther 2010 生物标记物研究 Other biomark