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高级森林生态学-植物群落的数量分析方法
高级森林生态学讲座 植物群落的数量分析方法 -分类和排序 王襄平 林学院生态教研室 wangxiangping@bjfu.edu.cn 什么是群落? 群落(Community):生活在同一区域内相互作用的不同物种的集合。 传统群落学研究的基本目的: 1) 研究区域有那些群落?-分类 2) 群落和环境的关系?-排序 1. 常用群落数量分析方法 数量分类(Classification) TWINSPAN 聚类分析 群落排序(Ordination) 间接梯度分析:PCA,CA,DCA,NMDS 直接梯度分析:CCA,RDA 排序方法之间的关系 PCA: 主成分分析 (principal components analysis),基于欧氏空间距离 RDA: Redundancy analysis CA: 对应分析 (Correspondence analysis),基于Chi-square距离 DCA: 去趋势对应分析 (Detrended correspondence analysis) CCA: 典范对应分析 [Constrained (canonical) correspondence analysis] NMDS: Non-metric Multidimensional scaling 分类和排序:区别和联系 分类:基于整体论观点 群落类型是自然单位,和有机体一样具有明确的边界,而且与其他群落是间断的、可分的,因此可以象物种那样进行分类。 主要目的:划分群落类型。 排序:基于个体论观点 群落是连续的,没有明确的边界,它不过是不同种群的组合,而种群是独立的。 主要目的:研究不同群落、物种对环境梯度的反应。 分类和排序:区别和联系 都是基于空间距离 所得结果具有相似性和互补性 可以同时使用以获得最佳分析效果 物种有无、多度、盖度、高度、频度、基面积等 物种多样性 物种之间的关系:种间联结 环境数据:地形、气候、土壤等 群落数量分析的数据:物种矩阵和环境矩阵 空间距离必须满足以下条件: 当两者完全相同时,距离值必须为0 两者不同时,距离值必须为正值 对称:A到B的距离等于B到A的距离 满足三角形三边关系定理:A,B,C三点, AB(AC+BC) 空间距离矩阵 空间距离的种类 欧氏距离 Sorenson (Bray-Curtis) Jaccard Chi-square distance Correlation distance Relative Sorenson, Euclidean 在分析中注意应选取适当的距离测度 欧氏距离和Sorenson距离 4.1 TWINSPAN Two-way indicator species analysis 对数据进行CA排序,得到样方和物种第一排序轴,分别用于样方分类和物种分类。 优点:提供了各个类型的物种分布,而且物种和样地同时进行分类。 缺点:是基于CA排序发展起来的一种分类方法,继承了CA排序的一切问题。 TWINSPAN 4.2 聚类分析 步骤(以聚合法为例): 1. 计算出距离矩阵 2. 找出最相似的两个单元 3. 将二者合并为1个单元 4. 重新计算距离矩阵 5. 重复步骤2-4 6. 当所有样地合并为1个单元时停止 聚类方法 聚合(agglomerative) 从单个样方开始,逐步聚合,最后成为一个类群。 分划 (divisive) 样方总体开始,逐步分划成低级类群。 组间联结方法 三种联结方法结果差异 最近邻近体法 最远邻近体法 组平均法 可变β值法 5.1 群落排序(ordination)的概念 实质:基于群落组成特征和环境信息,将群落(样地)在多维空间中进行排布 排序的基本假设: 排序相邻的样地具有相似的物种组成; 如果两个样地具有相似的物种组成,就必然具有相似的环境条件; 排序相差很远的样地具有不同的物种组成; 具有不同物种组成的样地之间环境不同。 5.2 排序方法 一维排序 研究对象沿着单一的环境梯度变化 多维排序 研究对象沿着多维的环境梯度变化 如CCA 多维排序的基本原理:降维 多维排序的基本原理:降维 排序的优点: 同时反映具有复杂物种组成的群落沿着多个环境梯度的变化 排序图的含义 5.3 直接排序与间接排序 直接排序: 分析植被与已知环境梯度之间的关系 (即排序+回归分析) 如:CCA、RDA 间接排序: 通过排序轴与环境变量之间的相关性来分析植被环境关系(即排序后进行相关性分析) 如PCA、CA、DCA、NMDS 重要区别: 间接排序样点的位置仅决定于物种组成的差异 直接排序样点的位置由物种组成
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