广西地区HIV1流行亚型、基因变异性分析及耐药突变的实验的研究.pdfVIP

广西地区HIV-1流行亚型、基因变异性分析 及耐药突变的实验研究 浙江大学医学院 肿瘤学 博士研究生 齐海燕 导师 于晓方教授 中文摘要 艾滋病，即获得性免疫缺陷综合征(Acquiredimmunodefieiencysyndrome，AIDS) 是由人类免疫缺陷病毒(H1lmanimmunodeficiencyvirus，HIV)引起的一种免疫缺陷 性疾病．人体感染艾滋病毒后，机体免疫功能逐渐降低，最后因为各种机会性感 染而导致死亡．自1985年发现首例HIV-1感染者以来，艾滋病快速蔓延已经成为全 球瞩目的问题．2009年数据显示，艾滋病流行至今，全球大约已有6000万人感染 了艾滋病病毒，其中有2500万人死于该疾病．在中国，艾滋病也呈加速流行和蔓 延的趋势．根据中国卫生部、联合国艾滋病规划署(UNAIDS)和世界卫生组织(WHO) 联合公布的2011年中国艾滋病疫情数据显示，截至2011年底，中国艾滋病病毒感 染者和艾滋病病人(PLHIV)总共78万。中国已经成为艾滋病流行大国。广西省由 于其特殊的地理位置，一直是艾滋病流行较早及较为严重的城市．因此，有效地 预防和治疗艾滋病已成为当务之急．本实验收集了2008-2010年广西北海、百色、 南宁三个地区静脉吸毒人群67例，分别对Gag／Pol及Env基因进行扩增，并对该地 区主要流行毒株亚型特征、基因变异及耐药突变做出了详细分析．本研究分为以 下三个部分： Ⅱ 第一部分 广西地区HIV．1流行亚型分析 本部分实验旨在了解我国广西地区HIV-1毒株亚型的流行状况，我们于2008至 2010年分别在百色、南宁、北海等地区采集了67例HW-1阳性标本，经巢式PCR 扩增、纯化，测序，得到的序列用DNASIS软件进行编辑、校正后，使用Clustal National HW w软件与美国LosAlamos Database LaboratorySequcnce H1V核酸序 列库提供的参考序列进行比较，利用Mcga 可信性进行检验，重复1000次． 67例Gag．Pol序列与国际各亚型标准序列进行系统进化树分析显示，在广西省 不同地区，由于HIV-I传播的来源不同，使得HIV．1亚型复杂多样．在北海地区 的25例标本中，14例为CRF08BC(56．0％)，9侧为CRF01 AE(36．O％)，2例 是CRF07BC(8．O％)．南宁地区21例标本中，16例为CRF08BC(76．19％)，3 AE 例为CRF0114．28％)，剩余2例为CRF07BC(9．52％)．值得注意的是我们 检测的百色2l例标本中，只发现了CRF08BC这种重组毒株．说明这种亚型可能 是百色静脉吸毒人群中HIV．1流行的主要毒株．其中被确定为CRF07BC亚型的 4个序列中，P6domain均发现有7个氨基酸的缺失，但其生物学意义还不是十分 清楚． 追踪HW-1传播路线时我们发现，云南是我国HIV．1感染最早的城市之一，该 地区的主要流行毒株是CRF08BC，而且百色与云南地理位置较为接近，所以我们 有理由相信HW-1的传播路线就是从云南省到广西省这样一个与毒品交易相符的 传播过程。随着广西省从西向南地理位置的迁移，我们发现，主要感染人群的CRF 08BC重组毒株的比例在逐渐下降，而CRF01AE重组毒株的比例却在逐渐上升． 给我们展现出两种完全不同的重组形式在地域分布上的特点． HI 第二部分 HIV-1基因变异分析