基因功能的研究方法精品.pptVIP

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  • 2016-01-26 发布于湖北
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第十章.基因功能的研究方法(一) 确认DNA顺序中的基因序列后,下一个问题就是探知其功能,这是基因组研究的一个难度很大的领域。 一些已完成测序的基因组顺序分析表明,我们所了解的基因组内容比真实的情况少的多。如大肠杆菌与啤酒酵母,在未开始基因组测序前已经完成了大量常规的遗传学分析,当时遗传学家认为这2种生物的大多数基因已经通过突变鉴定,但实际上还有很多空白。 大肠杆菌编码蛋白质的4288个基因中,以往知道的只有1853个,仅占43%。至于啤酒酵母,所知更少,仅为30%。 一、计算机预测基因功能 计算机预测基因功能的依据仍然是同源性比较。同源基因都有1个共同的祖先基因,他们之间有许多相似的顺序。同源基因可以分为2类: 种间同源基因或直系基因(orthologous gene) 这是指不同物种之间的同源基因,它们来自物种分隔之前的同一祖先。 种内同源基因或平行基因(paralogous gene) 同一种生物内部的同源基因,它们常常是多基因家族的不同成员,其共同的祖先基因可能存在于物种形成之后,也可能出现于物种形成之前。 同源基因一般不会有完全一致的核苷酸顺序,因为这两个基因在出现后独立的发生随机突变,但它们有相似的顺序组成,大部分未突变的核苷酸位置是相同的。 当一个新的基因序列被确认后,根据同源性可从数据库中查找已知顺序的同源基因。根据进化的相关性可从已知的同源基因推测新基因的功能。

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