海洋浮霉状菌分生态学研究.pdf

摘 要 由于具有“细胞器”和缺少肽聚糖等特性，浮霉菌成为研究细菌和真核细胞之 间进化关系的模式微生物，近年来已经是微生物中研究的热点之一。以前的工作 显示浮霉菌在海洋碳和氮循环中起着重要的作用，如厌氧氨氧化过程对于海洋N 循环中氮气的形成有30．70％的贡献率。虽然针对于浮霉菌的调查在不断的增加， 但对于海洋环境中浮霉菌的分布、多样性及其丰度知道的还是非常有限。本论文 主要涉及海洋浮霉菌的分子生态学研究，包括以下方面的工作： 1)本文应用16SrRNA基因的手段调查了南中国海一沉积物柱状样和西太平洋 一纬度梯度的表层水样浮霉菌的组成。对于南中国海沉积物柱状样(7个层， 显示浮霉菌只存在于有限的层(§m)，并且随着沉积物深度的增加浮霉菌的多 样性下降，沉积物中所得到的浮霉菌的序列主要是Pf陀胁妇属的序列；对于西 太平洋表层水，尸抛胁妇·腑咖p妇zf妇醐口，如矽f陀胁妇(PRB)是浮霉菌的最重 要的组成，并具有较高的多样性，而其它属GP堋嬲细和纠册cfD删只发现 于H5和H2站位，且低纬度的表层水中浮霉菌的多样性比中纬的要高些。应 用LIibshufr软件统计分析的结果显示沉积物和表层水浮霉菌的组成存在显著 性差异，可能是受复杂的水文条件、各种不同的地化环境因子的影响。 2)设计并得到二条浮霉菌特异性后引物，在理论和实验上都证明所获得的新引 物可以大大的提高浮霉菌特异性前引物的扩增能力，实验结果显示新引物可以 在属的水平上补充浮霉菌的多样性；表明以前只用引物PI“6F／1392．R对浮霉 菌的调查存在低估的可能。 3)获得了南中国海沉积物0．1m层参与氨氧化的微生物的分子证据(包括厌氧氨 V 氧化细菌的16S rRNA基因序列 rRNA基因序列、声变形菌氨氧化细菌的16S 及氨氧化古菌的氨单加氧基因硎DA的序列)，显示了沉积物中复杂的氨氧化 微生物的组成，为认识海洋沉积物氨氧化微生物群落中复杂的竞争或协作的关 系提供信息。 4)应用CARD．FISH技术揭示了长江口及三个南中国海剖面站位浮霉菌的丰度。 虽然长江口浮霉菌的丰度(O．23．20．53×104个细胞／毫升)要高于南中国海水柱中 的浮霉菌的丰度(0．15．10．25×103个细胞／毫升)，但本研究的结果低于以前报道 的在沉积物和土壤中浮霉菌的丰度。 关键词：浮霉菌；16SrRNA基因；厌氧氨氧化；CARD．FISH Ⅵ Abstl譬cl In他cent omoftIle f醅used decades，胁，lc伽叼，凹，嚣h硒become grou盼for amicrobialmodelt0 theeV0lutiDn h．tween P细瑚幻缈f嚣is explore relationship bacteria锄d for砥char∞teriSticof eukaD，0tes comp咖ent粕dpeptidoglyc锄·less． PreViouswo水showed marinec盯b(m that‰c幻彬f嚣pIayedimportant∞l鹤in and suchaSanammoxa竹ributedto30-70％m撕ne nitrogencycles processes nitr99∞ haVebeen is ga