几个基因家族在胚苗水稻不同倍性中的表达差异比较.pdfVIP

几个基因家族在胚苗水稻不同倍性中的表达差异比较.pdf

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几个基因家族在胚苗水稻不同倍性中的表达差异比较.pdf

摘 要 多倍化是植物进化中的自然现象,在被子植物中,约70%的开花植物在进化史 上都发生过一次或多次多倍化事件。多倍化的直接效应是导致基因组发生部分或全 部的重复,而这种基因组的成倍变化必然对基因的RNA的表达量产生巨大的影响, 进而影响到蛋白的表达,最终影响整个植株功能和性状的表达。 本研究以四川农业大学双胚苗水稻SARII.628群体中自然发生的同源单倍体、 二倍体及三倍体为研究材料,根据彭海等的基因芯片的结果,利用实时荧光定量 PCR方法进一步分析了单倍化和三倍化后在RNA水平发生的表达量变化情况。根 据基因芯片的初步分析结果,选择5个在不同倍性水稻中表达均有不同的功能基因 家族为研究对象,分析它们变化位点的表达与倍性调控是否存在一定的关联,确定 其关联是否与其功能相关。初步结果如下: 1、根据芯片结果初步选定的5个功能基因家族为:与甲基化形成相关位点、MBD 蛋白家族、乙烯合成相关位点、SNF2家族中与基因调节相关位点及DNA重组修 复相关位点,采用荧光定量PER方法对基因家族的17个表达位点进行验证,发现: 定量结果与芯片结果一致率达到76.92%,但部分位点的表达与芯片结果存在差异。 三倍体中表达量发生变化(其中单倍体特异变化的位点5个,三倍体特异变化的位 点5个,单倍体与三倍体共同表达变化的位点7个),结果如下: 1)在不同倍性水稻的108个位点中,相对于二倍体,其单倍体中表达上升、下降 和21.30%;而三倍体中表达上升,下降和无明显差异的位点各有97、2和9个, 中的表达趋势为:在单倍化后多倾向于下调的变化,在三倍化后则基本表现为 表达上调。 2)相同倍性单株在同一位点的表达变化具有一致性,但其中3个位点的表达变化 情况在9个单倍体中呈现无规律性。 3)单个位点的表达变化并不能影响类似功能在整个单株中的表达。 关键词:双胚苗,单倍体,三倍体,基因表达,实时荧光定量PCR 2 Abstract isnatural in evolution.In 70%of Polyploidyphenomenaplant angiosperms,about the havetaken onceormoretimesof in the floweringplants place polyploidization direct of evolutionary effect outthe history.The polyploidybrings genomeduplicated, and inthe ofthedoubleboundtoaffecttheRNA of changesgenome expressiongenes onthe affects affectsthewhole volume.Thereby,itproteinexpression,andultimately functionandthetraits plant expression. Inthis select ricestrainSAR which study,wetwin-seedling II-628,inhomologous OCCULTS and tothe resultsof naturallyhaploid,d

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