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大数据时代的儿科学研究—整合、优化、挑战与机遇
·246· ChinJEvidBasedPediatr Augest2014,Vol9,No4
·特稿·
DOI:10.3969/j.issn.16735501.2014.04.002
大数据时代的儿科学研究———整合、优化、挑战与机遇
1,2 1,3 1,3 1,3
李一飞 周开宇 华益民 母得志
一系列来自于信息技术及生命科学研究的突破,正在 医学证据的产生源从群体向“总体”转变。
引领医疗行业及生物医学产业发生重大的变革,这些变革 生物学相关的大数据分析基础是基因或者氨基酸等测
使得患者、医生和生物制药等相关个体之间的关系更为紧 序技术,通过大样本测序分析可以充分掌握特定生物体的
[1] [6,9]
密 。大数据(bigdata)存储与分析技术的应用,正是推动 生物学信息 。但对于医学来讲,大数据不只限于基因
[2,3]
这场变革的因素之一 。大数据分析使得相关研究者能 或者氨基酸相关的序列,还来自于医院的病历记录、相关检
充分的获取患者的基因组信息及相关医疗信息,并通过互 查资料、影像资料、暴露风险因素、保险记录及复诊记录等
[4] 信息[10,11]。这些一同构成了医学相关的大数据集合,这些
联网信息装置实现储存、转移、读取、分析和再利用 。因
此越来越多患病群体的基因及相关生物学信息被记录,从 整合过后的数据有利于更集中且针对性的阐明问题,而这
而引发生物信息知识爆发,促使医学及生命科学研究人员 些结论是传统抽样调查所不能达到的。例如,大数据集可
从经典的特定人群抽样研究方式逐步转变,未来相关研究 以确定对个人影响较小,但对于群体却具有一定累积效应
[5] 的风险事件。同样通过大数据整合,可以得到足够数量的
对象则可能无限接近于“总体” 。
罕见病或者受小概率暴露事件影响的病例,解决在独立临
1 大数据分析与医学知识整合 床研究中难以招募到足够的成员进行亚组分析的困境,以
大数据分析采用新一代信息学技术和架构,通过高速 便在大数据整合后的资料分析中获得足够的统计学检验效
[6] 能[10,12,13]。并且大数据整合后的医疗记录能用来跟踪个
捕捉数据,从中发现和分析得到有用信息 。目前大数据
分析需要在传统计算架构上进行转变,以满足研究人员能 体疾病进程及健康状态,以评估干预措施的长期影响。但
够同时储存并处理海量数据,并保证这些数据取用的方便 需要注意的是,通过互联信息技术手段整合而来的大数据
[7,8]
性与安全性 。由于激增的大数据信息量绝大部分为非 资源必然将存在一定的异质性,这也是以后大数据整合过
结构化信息,需要存储条件灵活多变,使得研究者不得不放 程中需要解决的问题。
[8]
弃传统格式化的数据库 。
尽管实现大数据分析需要面临诸多挑战,但伴随着数 2 儿科学特点与大数据分析
据生成、采集、存储、传输和信息安全等革命性的突破,使得 儿科较成人学科有更多的年龄分期,而且这些分期与
大数据分析的成本更加低廉、方便和快捷。此外,生物学和 解剖、生理、生化和心理行为等功能密不可分。胎儿期:从
医学数据比任何其他学科的信息更加多样化,这使得大数 受精卵形成致胎儿娩出脐带结扎,胎儿在宫内经受各种因
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