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利用微卫星标记分析31个中国地方绵羊品种的遗传多样性.pdf
146 2006学术年会
利用微卫星标记分析31个中国地方绵羊品种的遗传多样性。
马月辉“赵倩君杨燕闫景娟陈红艳苑存忠季香
狄冉央金郭军李宏滨关伟军
(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100094)
摘要:利用29个微卫星标记对中国31个绵羊品种进行了遗侍多样性分析,计算了品种的期望杂合度、观察杂台度、
观察等位基因数、有效等位基因数和遗传距离。浪卡子绵羊的平均杂合度最低为0.5276,太尾末羊的观察杂舍度最高为
0,6917。大尾寒羊与鸟骨羊的遗传距离最远为1.4488;卡拉库尔羊与柯尔克孜羊的距离最近为01153。基于Nel氏(1972)
类。巴什拜羊、多浪羊、策勒黑羊、和田羊、塔什库尔干羊、叶城羊、卡拉库尔羊、柯尔克孜羊、青海黑臧羊、阿勒泰羊、巴音布
鲁克、哈萨克羊、青海白藏羊、湖羊、晋中绵羊为第一类;迪庆绵羊、宁蒗绵羊、鸟骨绵羊、腾冲绵羊和昭通绵羊为第二类;浪
卡子绵羊、郏县大尾羊、豫西脂尾羊、岗巴绵羊、江孜绵羊、安多绵羊和林周羊聚为第三类;小尾寒羊、太尾末羊、山地绵羊和
洼地绵羊聚为第四类。
关键词:绵羊;微卫星;遗传多样性;系统发生树。
我国绵羊种质资源丰富,拥有50个品种,其中包括地方品种31个、培育品种9个和引入品种10
个”J。随着外来品种的引入以及杂交改良、人工授精和胚胎移植等工作的深入开展,我国古老的地方家
畜品种受到严酷的竞争和排挤,以至造成地方品种的群体数量急剧下降,有的甚至濒临灭绝。据1999年
的调查表明,枣北大尾羊已经灭绝,兰州大尾羊处于濒危灭绝状态,汉中绵羊等品种处于濒危状态,我国
绵羊种质资源面临严重危机。根据目前绵羊品种资源不断匮乏,遗传多样性不断减少,本研究旨在通过
微卫星标记对中国31个绵羊品种进行种质资源的遗传学检测,探明绵羊品种内和品种间的遗传变异、亲
缘关系、群体遗传结构,为开展品种资源保护和开发利用工作提供参考依据。
1材料和方法
1.1实验材料
选取中国31个地方绵羊品种和1个外来品种(无角陶赛特绵羊)作为实验材料(表1),每个绵羊品种
的样本含量基本上都在44~50之间。选择没有亲缘关系的个体,剪取耳组织约10mg,75%酒精浸泡低温
eta1.
带回实验室,冻存于一70℃冰箱中备用。基因组DNA提取采用常规的酚抽提法,具体参照Smnbrook
(2002)方法。
表1 31个中国地方绵羊群体名称、来源及样本数量
·基金项目:国家自然科学基金项目和基础性工作项目(2002DEBl0051)
..作者简介:马月辉(1964—8),男,吉林,主任,博士,博士生导师,畜禽种质资源.Email:yuehui.m@263net,Tel:010
1.2实验方法
1.2.1微卫星标记
个等位基因。本研究所用的引物是从GenBank等数据库网站查得,并从中筛选出符合要求的29个微卫星
BMS875,MB009,BM34137 BM3501、BMl341、BMSl678、BM彤107 BMl225、BM203,MB0237 7
1.2.2微卫星分析方法
PCR反应体系:Mgck(1.5mmol/L)1.2止或1.5gL,10xbtfffer1.2皿,dNTPs(0.2mmol/L)I.2皿,
Primer 5.1—4.8
mk(0.5 DNA聚合酶(5.0
tmM/L)1.0汕,毙g U/扯)0.2~0.3止.,ddH20FL,DNA模板
(60耐皿)2.0止。
PCR反应程序:95℃预变性5rain,然后94℃变性30B,50—60‘c退火30s,72cc延伸30s,30—33个循
环后,72℃延伸10nfin,4。保存。
采用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离微卫星等位基因。应用柯达电泳凝胶呈像数码分析系统
KODAS
(EASTMANEDAS)分析基因型和基因片段大小。
1.3统计分析
由于微卫星为共显性遗传,基因型直接反映表型,等位基因频率可通过简单计算获得。等位基因频
平均法(uPGMA)构建系统发生树。
2结果
2.1
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