分子电性距离矢量用于苯酚类化合物生物活性的QSAR研究.pdfVIP

山西大学学报(自然科学版)34(3)：468～474，2011 JournalofShanxiUniversity(Nat．Sei．Ed．) 文章编号：0253—2395(2011)03—0468—07 分子电性距离矢量用于 苯酚类化合物生物活性的QSAR研究 张建1，孙体健1，刁海鹏1，李美萍2 (1．山西医科大学基础医学院化学教研室，山西太原030001；2．山西大学生命科学学院，山西太原030006) 摘 要：采用分子电性距离矢量(MEDV)表征4组卤代苯酚和取代酚类化合物的结构，并采用逐步回归对变量进 行筛选。分别用多元线性回归和偏最小二乘回归建立各组化舍物的结构与其生物活性的定量结构一活性相关 (QsAR)的数学模型．同时采用内部及外部双重验证的办法对48种卤代苯酚结构与其抗茵活性(IgPC)关系模型的 稳定性进行分析和验证．多元线性回归建模相关系数R一0．960，标准偏差SD=0．248，留一法交互检验Rcv= 致．结果表明，MEDV能较好地表征该类分子的结构信息，所建模型具有良好的稳定性和预测能力． 关键词：分子电性距离矢量(MEDV)；卤代苯酚；取代酚；定量结构一活性相关(QSAR) 中图分类号：0621．15 文献标识码：A 酚是中等强度的化学毒物，其挥发可使大气受污染，含酚的废水流人农田会使土壤和地下水被污染，造 成农作物减产或枯死，水生生物受到抑制，繁殖下降，生长变慢，严重时导致死亡．酚类化合物对人体也有很 大的危害，酚侵入人体会与细胞原浆中蛋白质结合形成不溶性蛋白，使细胞失去活性，对神经系统、泌尿系 统、消化系统均有毒害作用．分子的生物活性是由其微观结构决定的，从分子层面出发进行研究才能弄清上 述现象的机理并解决酚类污染带来的一系列问题，因此进行卤代苯酚和取代酚类化合物的定量结构一活性 相关(QSAR)的研究是十分必要的．研究化合物生物活性的方法很多[110。，而将分子电性距离矢量(MEDV) 用于酚类化合物对水生生物呆鲦鱼急性毒性，抗菌活性研究少见文献报道． DistanceVectorbasedon4atomic 本文采用分子电性距离矢量(MolecularElectro-negativity types，简 Linear Least Regression，MLR)和偏最dx--乘回归(PartialSquare (Multiple 化合物与其生物活性的定量结构一活性相关(QSAR)模型，同时采用内部及外部双重验证的办法对48个卤 代苯酚结构与其抗菌活性logPC关系模型的稳定性进行了分析和验证． 1基本原理与方法 用分子图论或结构参数对有机分子的各种特性的预测，已经为越来越多的化学家所感兴趣．在研究定量 个由几个结构参数组成的矢量．而MEDV即是由化学分子图论方法结合相互作用关系衍生推导得出结构参 数的一种矢量．通常分子由各种不同属性的原子按不同连接方式(化学键)构成．而原子之间的相互作用与原 子电性及相隔距离密切相关．一般而言，依据库仑定律，电性越大，距离越小，相互作用就越大．另一方面，不 收稿日期：2010·10—15；修回日期：2010—12—29 基金项目：山西省科技攻关项目(20090311057—1) 作者简介：张建(1983一)，男。山西太原人，助教，从事有机化学研究．E-mail：blade-sword@sohu．com 万方数据 张建等：分子电性距离矢量用于苯酚类化合物生物活性的QSAR研究469 同原子类型之间的相互作用方式也不同．原子间相互作用取决于各原子相对电负性和它们之间的相对距离． 刘树深、李志良等[11 的原理与计算方法已经有了比较清楚详细的描述，在此，本文就不再细述． 2数据集选取及回归分析 2．1 数据集选取及多元线性回归模型的建立 Linear 多元线性回归(Multiple 性拟合以得到最小二乘(LeastSquare，LS)意义上的最佳结果．首先根据文献Ⅲ1计算出本文所研究酚类化合 物的MEDV值，并根据所研究酚类化合物已有的不同生物活性实验数