野大豆碱胁迫转录谱和基因组整合研究.pdf

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ClassifiedIndex: U.D.C: for inScience DissertationtheDoctor Degree INTEGI乙盯IONOFMICROARRAYAND GENoMEANALYSISIN ALKALINE.STRESSED Candidate: Ge Ymg Prof.Zhu Supervisor: Yan.Ming Academic for:DoctorofScience DegreeApplied Speciality: Bomny June8.2010 DateofOralExamination: Northeast University’: AgriculturalUniversity 1.1研究的目的和意义……………………………………………………………………·l 1.2文献综述………………………………………………………………………………l 1.2.1盐碱胁迫及植物耐盐碱机理……………………………………………………l 1.2.2植物耐盐碱组学研究…………………………………………………………..6 1.2.3基因转录谱数据挖掘方法……………………………………………………10 1.2.4大豆和野大豆基因组测序进展……………………………………………….19 1.3课题来源与本论文的主要研究内容………………………………………………….22 1.3.1本研究课题的米源……………………………………………………………22 1.3.2本论文的主要研究内容………………………………………………………22 1.3.3本研究的特色及创新点………………………………………………………22 2材料与方法…” 2.1材料……………………………………………………………………………………………………………..24 2.1.1植物材料………………………………………………………………………24 2.1.2芯片材料………………………………………………………………………24 2.1.3试剂及耗材……………………………………………………………………24 2.1.4数据库…………………………………………………………………………24 2.1.5生物软件………………………………………………………………………24 2.2方法……………………………………………………………………………………………………………”25 2.2.1植物材料处理及芯片杂交……………………………………………………25 2.2.2芯片杂交结果的realtime.PCR验证………………………………………….26 2.2.3芯片杂交数据预处理…………………………………………………………29 2.2.4碱胁迫应答基因筛选…………………………………………………………30 2.2.5碱胁迫应答基因聚类分析…………………………………

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