秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析-大连海洋大学.pdfVIP

第30卷第2期 大 连 海 洋 大 学 学 报 Vol.30 No.2 20 15 年4 月 JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITY Apr . 2015 DOI:10.3969/ J.ISSN.2095-1388.2015.02.006 文章编号:2095-1388(2015)02-0143-06 秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析 1 1 2 1 1 1 1 窦妍 , 丁君 , 曲凌云 , 刘志敏 , 王轶南 , 穆晓虎 , 常亚青 (1郾 大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室, 辽宁 大连 116023;2郾 国家海洋局 第一海洋研究所, 山东 青岛266061) 摘要: 以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、 冬季海水和沉积物基因组DNA为模板, 以细菌16SrDNA通 用引物进行PCR扩增, 构建16S rDNA文库并进行测序分析, 研究了秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性。 结果表明: 海水和沉积物中主要包括 11个门类的细菌, 即变形菌门 (Proteobacteria)、 酸杆菌门 (Ac鄄 idobacteria)、 放线菌门 (Actinobacteria)、 拟杆菌门 (Bacteroidetes)、 疣微菌门 (Verrucomicrobia)、 厚壁菌 门 (Firmicutes)、 梭杆菌门 (Fusobacteria)、 蓝细菌门 (Cyanobacteria)、 浮霉菌门 (Planctomycetes)、 脱铁 杆菌门 (Deferribacteres)、 绿弯菌门 (Chloroflexi); 黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均 为变形菌 (变形菌比例48%); 用Shannon指数及Simpson优势度指数分析细菌的多样性, 黄、 渤海刺参 养殖池塘中, 冬季沉积物细菌Simpson优势度指数均最低, 分别为0郾014 89和0郾01650, Shannon指数均最 高, 分别为6郾312和5郾695。 研究表明, 黄海和渤海刺参养殖池塘中, 冬季沉积物细菌多样性均最高。 关键词:刺参; 养殖池塘; 16S rDNA; 变形菌门 中图分类号: Q954郾4摇 摇 摇 摇 文献标志码: A 摇 摇 自20世纪80年代中国刺参人工育苗技术取得 仿刺参肠道可培养微生物的多样性。 成功后, 刺参的增养殖在北方沿海逐渐实现规模 本研究中, 采用 16S rDNA文库法, 通过系统 [1-3] 化 。 然而, 随着养殖规模的不断扩大, 刺参病 发育分析和多样性分析, 对黄、 渤海刺参养殖池塘 害也日益增加。 良好的环境是刺参健康生长的必备 海水和沉积物的菌群结构及多样性进行了研究, 并 条件, 而养殖池塘生物群落的重要组成部分———水 分析了其中潜在的条件致病菌, 旨在了解黄、 渤海 体及沉积物中的微生物, 可以作为衡量环境优劣的 刺参养殖池塘细菌群落结构, 为构建中国北方刺参 [4] 指标 。 因此, 考察养殖环境中细菌的多样性, 养殖池塘菌库奠定基础。 可以为微生物生态变化与刺参病害发生的关系提供 [5] 1摇 材料与方法 一定的科学依据 。 环境中可培养细菌的多样性占微生物总数的量 1郾1摇 材料 极低, 基于培养的研究方面很难全面了解环境微生 [6] 物的多样性 。 随着 DNA测序技术的发展, 以环 黄海秋、 冬季刺参养殖池塘沉积物和海水样