双分子遗传标记新扬州鸡早期生长关系的联合分析.pdf

中文摘要 本研究以我院培育的蛋、肉兼用型新扬州鸡为试验材料，系统研究OPAY02型和 EAV／DNA指纹条带J型分子遗传标记对新扬州鸡早期生产性能的影响，为新扬州鸡早 期生长标记辅助选择提供有效的遗传标记。试验共测定了不同饲养环境下两个连续世代 (群体2和群体3)和一个独立世代(群体1)新扬州鸡群体早期生长、屠宰性能。利用 新扬州鸡三个世代中的两个世：代(群体1和群体3)资料，研究分析了新扬州鸡早期生长 规律，以不同的饲养环境为单元，应用单元内全同胞组内相关法和混合模型约束极大似 然估计统计分析法(REML)估计了新扬州鸡早期体重的遗传力：以两个不同世代(群 OPAY02 及它们的不同组合型标记对新扬州鸡早期生长和屠宰性能的影响；用生物信息学手段对 OPAY02两个测序条带进行网上核苷酸数据库序列比对搜索，分析了两片段序列在鸡染 条带J捌分子遗传标记不同组合对新扬州鸡早期生长的影响，利用原位杂交技术将 OPAY02型标记定位在染色体上。 研究结果如下： 型拟合参数表明，新扬州鸡早期生长间于肉用仔鸡和地方品种，在兼用型培育品种中也 较为优秀。新扬州鸡体重生长过程和体尺生长过程比较表明体重生长旺盛期比体尺生长 要迟。 2、首次应用单元I匈全同胞组内相关法，混合模型约束最大似然估计法(REML)估计 的新扬州鸡0、2、4、6、8周龄体重性状的遗传力，除初生重外，其值在0．3～0．4之间， 属中等遗传力，适合与体重关联的分子遗传标记的检出，同时也有利于分子标记辅助选 择： 3、PCR条件优化后， 电泳结果和条带经克隆、测序后转化成SCAR标记的分析结果差异极小。说明经条件 的分子量大小和琼脂糖扩增结果间有一定差异。用分子量标记计算得到的扩增条带的 分子量只能作为参考。生物信息学分析表明2326条带与鸡基因组数据库中的3号染色 俸8982～1 1550核苷酸有99％的同源性，而1660条带在鸡基因组数据库中没有搜索到 I司源序列。 4、统计分析结果表明，新扬州鸡群无论是群体2还是群体3，2326条带的单独效应均 表现为增效效应，1660条带表现为减效效应。前者表现为有该条条带的群体体重比没 有的要高，后者正好与其相反。新扬州鸡两个不同群体OPAY02两个多态性条带分子 遗传标记联合分析结果表明，两条多态性条带问存在互作，C型标记无论是对早期体 重还是12周龄主要谱宰性能均有显著的增效效应。 5、试验用Dig标记的EAV为探针，EcoR 交，苗次在新扬州鸡群体水平上获得rEAV／DNA指纹图，试验结果表明，高质量的 DNA指纹阁谱主要受两个因素的制约，即未标记探针的纯度直接影响随机引物法标记 探针的质量：基因组DNA的抽提质量和酶切质量影响指纹图谱的获得。和前人不同群 体研究的结果比较发现EAV／DNA指纹图谱中条带J的出现频率具有群体特异性，生长 速度快的群体其频率低．生长速度慢的群体频率高，一定程度上证明了对J带选择是有 效的。 互作用，广义线性模型分析结果表明，条带J和OPAY02引物1660条带一样，其单独 对I一期增重的影响具有显著的减效效应，即有J条带的个体组成的群体相同日龄体重小 型标记的两条多态性条带的不同组合其早期增重有显著差异，而且这种效应具有长的时 t组 效性．．住JS：S。组合分子标记中，J-S2+S1-组合群体具有提高体重生长的作用；在Js 合分子标记巾JS。。的效应最大，极显著地大于其它3个组合；在JS2的3个组合分子标 记中JS：2+的效应最大，显著大于其它2个组合，虽然J’s2+在Js2组合分子标记中效应最 大，但不及前两者。J。s2+S1-和J。s，一组合分子标记的作用相同，而且两者的群体平均水平 相当：与各标记单独效应比较各时期组合标记的效应大于单个标记的效应。所以选择 J’S1’较为经济。 7、利用小实验建立的方法可以得到较为清晰的染色体原位杂交图谱。以OPAY02型标 i已两条多态性条带为探针，新扬州鸡染色体原位杂交结果把1660片段的DNA初步定 位在5号染色体的长臂近端位置。将2326片段的DNA定位在3号染色体的长臂近中 f讧蜀。2326条带染色体定位结果与第三章鸡基因组同源序列比对定位结果相同。 标记：标记辅助选择；原位杂交 ABSTRACT Inorder