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利用微卫星标记估10个中国地方猪品种的遗传多样性
———竺曼兰兰苎竺墨竺苎!!!!!兰查竺苎兰竺兰!兰竺苎
利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性
推荐的51对微卫星标记的荧光引物中的20对引物,借助ABl310自动测序仪,检测
我国10个地方猪品种(嵊县花猪SX,南阳黑猪NY,嘉兴黑猪Ⅸ。淮南黑猪HU,
DNA水平上的遗传多样性。结果表明,在20个微卫星座位上,10个猪品种具有的等
位基因数目和频率均不同程度地呈现出变异,南阳黑猪具有的平均等位基因数目最多
SW2439:133
bp等位基因,SW938:144bp和146
190 bp等位基因,PDYN:137bp和139bp等位基园,
bp等位基因,SWl42:13l
SWl668:186bp,206bp和208
S0167:214
bp等位基因,为10个猪品种所共有,推测它们可能是我国猪基因组中最
bp等
位基因只在淮南黑猪出现。SWl684座位上的1 bp等位基因只在南
17bp,121bp,127
阳黑猪出现。SW2439座位上的1 17
13bp,1 bp等位基因只在嘉兴黑猪出现。
15bp,1
SWI【364座位上的146bp,202bp,220bp等位基因只在赣西两头鸟出现。SW938座位
上的176
bp等位基因只在嵊县花猪上出现。SWl325座位上的108bp等位基因只在沙
子岭猪上出现,而126
bp等位基因只在海南花猪上出现。SWl632座位上的152bp,
bp等位基因只在监利猪上出现。SW2509座位上
158bp,190bp.192bp,194bp,202
的】48
bp等位基因只在东山猪上出现。SWl42座位上的】03bp和107bp等位基因只
在金华猪上出现。不同品种,不同位点的特定等位基因见表3。通过20个微卫星座位
平均多态信息含量和平均遗传杂合度2个指标的比较,10个猪品种内遗传变异程度大
小依次为海南猪、嵊县花猪、南阳黑猪、监利猪、沙子岭猪、嘉兴黑猪、淮南黑猪、
东山猪、赣西两头乌、金华猪。从平均有效等位基因数的比较来看,10个猪品种内遗
传变异程度大小依次为海南猪、嵊县花猪、南阳黑猪、沙子岭猪、嘉兴黑猪、淮南黑
猪、监利猪、东山猪、赣西两头乌、金华猪。群体间遗传分化系数(GsT)和固定指数
华中j担业太攀硕士穗-文
(FsT)表明,10个猪品种的遗传变异大部分(约78%)存在于品种内,只有少部分
品种的遗传关系与我国猪种类型划分基本一致,但也略有不同,同属于华中两头乌的
4个品种监利猪、东山猪、赣西两头鸟和沙子岭猪以及浙江金华猪在Nj聚类图和
UPGMA聚类图上,聚成一类,其它5个品种聚成一类,是符合实际情况的,从小的分
枝来看,嵊县花猪和南阳黑猪,淮南猪和海南猪的遗传距离最近,分别聚成一类,似
乎有点让人难以置信,,因此本研究对其分化时间进行推算,发现以上4个猪品种的分
化时间大约在620.630年前,即公元1372.1382年,而中国历史上,这段时期正是明
朝洪武年间,内地民族大迁徙的时期,在明政府的高压下,中原地带(即河南、山
西、河北等地)向沿海大搬迁,因此推测原属猪品种的南阳黑猪、淮南猪分别和原嵊
县、海南猪品种发生了基因交流。但是要提高此推测的可靠性还需其他的旁证相佐,
例如可以把以上地方品种的鸡,狗,鸭,猫或牛同样做亲缘关系的分析,观察上述品
种是否出现一到两个类似的结果。本研究结果提示,仅依据地理分布、生产性能和外
貌特征等分类,并不能完全反映各个品种间的遗传关系和彼此遗传本质的差异。猪品
种的亲缘关系和分化时间在某种程度也反映了人类历史的变迁。
关键词:猪微卫星遗传多样性
利用做卫且摭记评估10十中田地方藉品种的遗传多样性
Genetic of10
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