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水稻白叶枯病菌传多样性分析
中文摘要
因序列自行设计引物、以及利用几个与无毒基因相关片段为探针研究中国、日本和
菲律宾水稻白叶枯病菌的遗传多样性与致病性之间的关系。
叶枯病菌(Xanthomonas
oryzae
系的PCR扩增结果表明,参试菌系表现出地域性差异。以70%为簇界,对4种引物
扩增结果进行UPGMA综合聚类,三个国家的茵系共分6个分子簇,1簇菌(60.5%)
是三个国家菌系的主要分子簇,说明大多数参试菌系之间的遗传关系密切。对17组
56株中国、日本和菲律宾的水稻白叶枯病菌母株和它们的单细胞系的研究结果表明:
类,母株与单细胞系完全相同的,只有1组;以带位相似率70%为簇界,参试菌可
以划分为7簇,来自中国、日本和菲律宾的12个组的母株和单细胞系聚合在同一簇
中,占参试菌的70.6%,说明三个国家病菌的母株和单细胞系在遗传上存在高度相
关性:但三个国家的病菌的母株与其单细胞系之间也存在簇群差异,如Px079组的
母株和单细胞系各分在不同的3簇中,Px079,Px086,Px099和Pxol12等菌系的母株
和单细胞之间的差异率达到了41%;iii)致病性测定结果表明,中国、日本和菲律宾
茵系的病原型分化明显,菌系之间存在有明显的致病性差异。同时参试的17组56
个菌系的致病性测定结果表明,只有2组的母株和单细胞系的毒力相同,占11.8%。
其余15组的母株和单细胞系的毒力存在致病性差异。
其次,利用已知的水稻白叶枯病菌无毒基因以及致病相关基因序列,开展水稻
白叶枯病菌株的毒力分化研究,获得如下结果:
稻白叶枯病菌系的基因组DNA进行PCR分析。结果表明这19个参试菌株的基因组
中都含有与我们引物设计所利用的无毒基因相关的同源片段。同时结果也表明利用
小片段的无毒基因中的保守序列设计的引物,不能有效的区分菌株,而利用无毒基
因的大片段设计的引物可以较好的区分不同国度的菌株。
为探针,研究19个来自中国、日本和菲律宾水稻白叶枯病菌系的基因组DNA,对
酶切,HXAl4.3为探针的组合的结果最有代表性。
但是本试验中参试菌系的PCR检测结果、RFLP结果和聚类分析结果均未发现
与病原菌的致病性之间具有相关性。
关键词:水稻白叶枯病原菌;单细胞系;遗传多样性:毒力分化;分子谱型
Ⅱ
Abstract
lll 111
2,IS
n伦IS—PCR(J3,IS3),Rep—PCR(ERIC),HXAprimers(HXA·9,
HXA一1 RFLPwereusedto Xanthomonas
4,HXA一15),and analyze oryzae
pv.oryzae
strainsfrom andthe
China,Japan
Philippines.
and wereusedto ofXoostrains.
First,IS-PCR
Rep-PCR analyzegeneticdiversity
Thestrainshadvariance data
onthePCRresult.Combinedthe
amonglocations,based
four clusters
from wereobtained UPGMAatlevelof70%
primers,6 byusing analysis
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