水稻齿叶矮缩病三个分离物slt;,6gt;-slt;,10gt;片段的基因结构特征分析.pdfVIP

独创性声明 本人声明，所呈交的学位(毕业)论文，是本人在指导教师的指导下独立完 成的研究成果，并且是自己撰写的。尽我所知，除了文中作了标注和致谢中已作 了答谢的地方外，论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果。与我一同对本 研究做出贡献的同志，都在论文中作了明确的说明并表示了谢意，如被查有侵犯 他人知识产权的行为，由本人承担应有的责任． 学位(毕业)论文作者亲笔签名；昊文受。 日期： 柳．歹．幻 论文使用授权的说明 本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位(毕业)论文的规定，即学 校有权送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅；学校可以公布论文的全部或 部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 保密，在+年后解密可适用本授权书。 口 不保密，本论文属于不保密。 口 学位(毕业)论文作者亲笔签名：关父毽 指导教师亲笔签名： 汤’猁 水稻齿叶矮缩病毒三个分离物S。一S．。片段的基因结构特征分析 摘要 stunt 水稻齿叶矮缩病毒(#ice virus，RRSV)引起的水稻齿叶矮缩 ragged 病是南亚和东南亚稻区的重要病毒病，是呼肠孤病毒科水稻病毒属的典型代表。 本研究通过有机试剂抽提，CF一11纤维素柱层析，从感病水稻组织中获取该 病毒的全基因组双链RNA。根据泰国分离物(TH)对应片段的序列设计引物，通 过RT—PCR技术成功地扩增到RRSV福建长汀分离物、沙县分离物和广东信宜分离 物S。一S。。全序列，并连接NpMD一18T载体上，转化大肠杆菌DH5Q，质粒双酶切、 质粒PCR和质粒PCR产物单酶切验证后经测序得到全长序列。 对测序完成的RRSV福建长汀分离物、沙县分离物和广东信宜分离物S。一S。。 全序列进行同源性分析，并对变异位点进行统计。对这些片段测序所得的核苷 酸序列初步分析表明，三个分离物S。。，S，与TH—SmTH-S，核酸同源性都为99％； 的某些碱基发生缺失，导致编码框移位而使得这些片段的开放阅读框(ORF)发 生变化外，其它片段ORF与已报道的泰国分离物基因组对应片段的ORF大小相 同。 借助生物学软件及相关在线分析工具进行基于氨基酸序列的生物信息学分 析，包括蛋白质理化特性、蛋白质功能域、基序(Motif)、二级结构等，分析表 PKKREKA)；NSIO蛋白、P9蛋白和P8蛋白各有一个R-2motif；P9蛋白有一个螺旋 卷曲区域，五个蛋白均无信号肽。 关键词：水稻齿叶矮缩病毒；基因组结构；生物信息学分析 摘要 Genomestructure on 6to 10ofRice analysis segmentsegment stuntvirus ragged Chineseisolates Abstract Rice stunt a member ofthe raggedvirus(RRSV)istypical genusoryzavirus withinthe ricediseaseinSouthAsiaand familyReoviridae，causingsignificant SoutheastAsia． ThedsRNAwasextractedfromRRSVinfectedricetissue CF一11ce