五个不同地区牦部分生产性能候选基因多态性的研究.pdf

中文摘要 基因遗传多态性进行了测定，分析了等位基因频率、基因型频率、多态信息含量、杂合 度和有效等位基因数等指标，并运用最d-乘法分析了所发现的基因多态位点与牦牛体 响生长发育性状候选基因的可能性，取得了如下研究结果： 1．利用PCR-SSCP技术对类胰岛素生长因子一I基因(巧卜，)多态性研究表明： 含子的PCR—SSCP多态性检测结果表明，该多态位点由一对等位基因A、B控制，序列比 对发现在67bp处单碱基C的缺失，造成了该多态位点的出现。等位基因A(B)在大通 牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、青海环湖牦牛、新疆巴州牦牛群体中的基因频率分别为： 等位基因A为五个群体中的优势等位基因。 著差异。在大通牦牛中检测到了从、BB和AB三种基因型，而在其它群体中只发现AA 型，呈单态型，达到了纯合状态。经克隆测序表明：该位点的多态是由于在202bp处一 个T—C的突变，导致等位基因A突变成等位基因B。 (3)对比卜，基因上2个多态位点不同基因型与大通牦牛6月龄生长发育性状指 标进行显著性检验，结果表明，尼卜，基因第1内含子从基因型的体重、体斜长显著 高于AB、BB基因型(JD锨05)。 (4)尼卜，基因的二个多态位点基因型与大通牦牛早期发育的分析表明，18月龄 差异显著(尸以05)。在牦牛的早期选育中，AA型个体可以作为选留的对象。 (5)六月龄大通牦牛群体体尺指标与甘南牦牛和天祝白牦牛群体比较可以看出不 论公牛群还是母牛群，大通牦牛的平均体重显著大于甘南牦牛和天祝牦牛群体平均体重 (尸m 05)：大通牦牛的平均体斜长显著比甘南牦牛和天祝白牦牛长(尸锨05)，而胸 围相比大通牦牛略高于其它两个群体但差异不显著(∥现彻。在这些体尺指标上，大 通牦牛表现出明显的优势。 果表明： B控制，其中A为优势等位基因，AA为优势基因型。五个群体的哈代一温伯格平衡检 验结果显示，青海大通牦牛、青海环湖牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛处于非平衡状态。 运用最小二乘法对三个牦牛群体进行分析发现GH基因第3外显子对体重有显著影响 (尸以05)，其中，最小二乘法得出的均值，AA型最大，AB‘型次之，最小的为BB型。 型次之，BB型体长最短。GH基因第3外显子对体高、胸围、管围无显著性影响(∥口05)。 Al为优势等位基因，A1A1为优势等位基因型。五个品种进行的哈代一温伯格平衡检验 结果显示，甘南牦牛处于非平衡状态；运用最小二乘法对五个牦牛品种进行分析发现第 5外显子对生长发育指标没有显著影响(抄现彻。 (3)经过PCR—SSCP分析，61t基因保守区位点呈单态性，没有发现多态性信息。 (4)经过PCR．RFLP分析，特异性GH．IR引物对牦牛基因进行PCR扩增，得到 I、HaeIII、HintI、PStI、Sma 一条长约1244bp的产物，用限制性内切酶Ava I进行酶 切，AvaI、HinfI、HaeIII、Pst I I均具有预期的酶切位点，没有发现多态性，而Sma 不具有预期的酶切位点，经测序比较，发现在878位点处的Sma I酶切位点“CCClOGO 丢失。 段。采用限制性内切酶HinfI、SmaI、Pst I对该PCR产物进行单酶酶切，结果发现mnf I、SmaI、Pst I均具有酶切位点，且电泳检测结果与预期相一致，不具有限制性片段长 度多态性。而GH-2R在限制性内切酶HaeIII的切点中，电泳检测结果与预期不一致， 经测序比较，发现在75位点处的酶切位点“cclGo’’丢失。 3．利用PCR—SSCP技术对PRL、PRLR基因多态性进行了研究，结果表明： 催乳素受体基因的第2外显子、第3外显子在大通牦牛、甘南牦牛、天祝白牦牛、 青海环湖牦牛、新疆巴州牦牛5个品种中检测到了从、AB和BB基因型，而且在PRLR- II 0．580和0．640。基因多态信息表现为中度