中国滇西北地区分离流行性乙型脑炎病毒的分子特征研.pdfVIP

·实验室研究· 中国滇西北地区分离流行性乙型脑炎病毒的 分子特征研究 孙肖红王环宇 潘晓玲付士红冯云孟维珊 梁国栋 【摘要】 目的对中国滇西北地区分离的流行性乙型脑炎(乙脑)病毒进行分子特征研究，了解 与云南省内其他地区病毒株的差异。方法用RT-PcR的方法扩增滇西北地区分离的13株乙脑病毒 1．8x、DNAsTAR、GENEDOC等生 Pr膨、E片段和3’非编码区。对扩增产物进行序列测定。用clus诅l 物学软件进行核苷酸序列和系统进化分析。结果基于P棚和E基闪核苷酸序列的系统进化显示，滇 西北分离的13株乙脑病毒中有12株属于基因l型，1株为基因Ⅲ型；12株基因I型乙脑病毒与云南省 其他地区分离的病毒株处于不同分支；和云南省其他地区分离株之间E基因核苷酸序列差异度为 O．2％～13．9％；3’非编码区存在两种核苷酸缺失情况，基因I型毒株在终止密码子后出现3处缺失，而 基因Ⅲ型毒株只有1处缺失。结论滇西北地区乙脑病毒分离株以基因I型为主，E基因核苷酸序列 与云南省其他地区分离株差异不明显；基因I型毒株在3’非编码区存在3处缺失，而基因Ⅲ型毒株则 只有1处缺失。 【关键词】流行性乙型脑炎病毒；分子特征；基因分型 AnalysisonmemoI∞ularcharactedsⅡ岱of ilINo劬w鹤tern Ja阳ne驰encephamis、rir啷isolated YmI咖pmvinceS己，Ⅳ施口D．^o，瑶，耽ⅣG胁mn—似，朋，vX洳一Zing，FU鼽i-胁，曙，，EⅣG玩n，肘E，vG D厶e∞部 耽i咚^口n，圳，vGG∞—dD，b昏加疵以e局r耽mZD厶印甚部CbmrDZ口，以Pr睨Iem如n，仍i，b即e(km盯加r Cb，Ⅱ捌口以_P舢m幻凡，＆f豇职100052，Chi∞ co小．spD蒯昭口以幻r：删ⅣGG∞一dD增，Email：gdli柏g@h0廿nail．com tllemolecularcharactcristicsof I Abstract】objectiveTb锄alyze Japaneseenc印halitis啊ms to be铆ecnmes仃aills inNorthwestamⅥm彻n di虢rellces (JEV)isolatcd province，柚dclari母the isolatedinNorthwestemandotller ofⅥmnan and3’untranslated parts province．MethodsPrM，E mlcleotideacid oftheisolates R，r-PCRandtllen re西on sequences were锄plifiedby sequenced．Sequence were C11lstal and ali印ment锄dphylogenetic锄alysispe响medbyllsing 1．8X，DNASTAR，GENEDOC 3．1 12ofme13isolatcsofJEVobtainedinNorthwestemYh衄锄werc Megaprograms．R郎lIlts as was JEV111e12s仃ainsof 1 were identified ones仃aill geno帅eI，only genotypeⅢof geno帅e clllsteredind