浙江省人感染H7N9禽流感病毒的基因组序列分析.pdfVIP

·604· ·实验室研究· 浙江省人感染H7N9禽流感病毒的 基因组序列分析 陈寅 茅海燕 李榛徐昌平 高见 冯燕 王欣莹 严菊英 张严峻卢亦愚 【摘要】 目的分析浙江省2013年4月初一例人感染甲型H7N9禽流感患者的病原学和基 因组序列特征。方法提取患者标本的病毒RNA并用荧光定量ImPcR方法检测，一步法 RT-PCR扩增H7N9禽流感病毒基因组的8个片段，测序并拼接出基因组序列。下载目前已经公布 的H7N9禽流感病毒和其他H7、N9亚型的病毒的HA和NA序列，采用Mega5．1软件对其进行序 列比对并构建进化树。根据测序的结果分析该例H7N9禽流感病毒的序列变异情况。结果该 患者标本甲型流感、H7亚型和N9亚型均为阳性，通过扩增基因组各片段并进行测序。对血凝素 和神经氨酸酶基因进行比对和进化树构建，结果显示该H7N9病毒HA基因与～duck／Zhejiang／12／ 编码内部蛋白的6个基因均与中国大陆近两年的H9N2毒株最为相似。该标本的病毒HA蛋白发 生了Q226L突变，而与已经公布的人感染H7N9禽流感毒株均不一致的是PB2未发生E627K突 变。结论从该份临床标本完成了检测和基因组各片段的扩增与测序。该病毒与已报道的人感 染H7N9禽流感病毒同源性高，存在Q226L等重要位点的突变，但PB2未发生E627K突变。 【关键词】H7N9禽流感病毒；基因组；序列分析；进化树 Genomic humaninfecti蚰of sequenc船of avian—ongininnuen臻A(H7N9)vir吣in Zhejiang C舰，v province Mn，似D讹i-归n，Ⅱ劢e凡，XU劬。昭-p咄，甜0以。几，阳ⅣG地n，船ⅣG 皿n圳昭，蚴Ⅳ知一yi增，z删ⅣG地n扣凡，￡U M吼．劢彬8昭PrD口iM趔‰y如60r0托町矿nc^n记nZ D蠡enseCo几￡，DZⅡ凡d mno秽Ⅱ￡ion／矗r几6f如月台of￡^．巨j，珊，jg℃，}cyZ)efec￡ion，．孙e面。凡g户锄i，}cioZ(1e凡￡er加r 肌秽e凡fion，．H0，￥留危ou310051，China c0嬲po蒯i愕口u琥or：￡UK．’，u，Email：luyiyl埘h@163．com 5c据ncen¨，M玩￡面n(No．Y207819)， 砚站姗也训珊s唧oned研gm，嬲加m肮e撇昭Pro”inc训^协umf 疏e尸，Dgmm扣r现咖彻g厶oding扎。mQ厂＆ie船eⅡ以死c^肋fo影如删o￡ion(No．2011R50021)Ⅱ几d ‰)，^矩d瑟oZSu6，ec拈(10瑚￡mct面n Pro，ecto厂Zk面口ng№i，圮e(No．XKQ一009—003)． To the and ofhuman 【Abstract】objec廿ve infectionof analyzeetiologygenomicsequences innuenzaA(H7N9)vims仔om ⅥmlIⅢAwasextracted aVian—origin Zhejiangprovince．Methods 行om of H7N9innuenzavimsinfectionandreal．timeIU乙PCRwasconductedfor patientssuspected detectionofviralRNA．A1l8 ofinnuellzavimswere ImPCRand se鲫ents amplifiedbyone．step