黄瓜CSHSP70基因内含子结构分析.pdfVIP

中国农业科学 2007,40(12):2915-2919 Scientia Agricultura Sinica 黄瓜 CSHSP70 基因内含子结构分析 1，2 1 1 1 1 杨寅桂 ，娄群峰 ，陈劲枫 ，刘 强 ，李为观 1 2 （作物遗传与种质创新国家重点实验室/南京农业大学园艺学院，南京 210095 ； 江西农业大学农学院，南昌 330045 ） 摘要： 【目的】探明黄瓜CSHSP70 基因的内含子数目及其结构特点。【方法】根据黄瓜 CSHSP70 基因 cDNA 序列设计引物，应用 PCR 技术从 gDNA 中克隆 CSHSP70 基因，采用 RT-PCR 技术验证内含子的存在。【结果】经测 序与拼接，得到长度为 4 056 bp 的黄瓜 CSHSP70 基因，它包含 7 个内含子。经分析发现这些内含子富含 A·T， 具有类似启动子和 HSE 核心结构的序列存在。对黄瓜、甜瓜和丝瓜 CSHSP70 基因部分序列的比较分析表明，该基 因在这 3 个葫芦科作物中具有很强的保守性。【结论】内含子存在的特殊结构表明其可能对该基因表达具有调控 作用。 关键词：黄瓜；叶绿体基质 HSP70 基因；内含子 Structural Analysis of the Introns of Cucumber CSHSP70 Gene 1,2 1 1 1 1 YANG Yin-gui , LOU Qun-feng , CHEN Jin-feng , LIU Qiang , LI Wei-guang 1 ( State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095 ; 2College of Agriculture, Jiangxi Agricultural University, Nanchang 330045) Abstract: 【Objective 】 The objective of this study was to examine the number and structure of the introns of the chloroplastic stroma HSP70 (CSHSP70) gene in cucumber. 【Method 】Primers were designed according to the cDNA sequence from cucumber CSHSP70 gene and cucumber CSHSP70 gene was cloned from gDNA using polymerase chain reaction (PCR) technique. The existence of introns was shown by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) technique. 【Result 】After sequencing the three fragments cloned from cucumber CSHSP70 gene, a 4 056 bp cucumber CSHSP70 gene with seven introns was obtained. Analysis of t