基于细胞色素b基因序列的中国牛亚科家畜系统发育关系.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(19):4081-4087 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.19.019 基于细胞色素b 基因序列的中国牛亚科家畜系统发育关系 1 1 2 2 2 2 耿荣庆 , 王兰萍 , 冀德君 , 常 洪 , 李永红 , 常春芳 1 2 （盐城师范学院生命科学与技术学院，江苏盐城 224051 ； 扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州 225009 ） 摘要：【目的】探讨中国牛亚科家畜物种间的系统发育关系，为牛亚科家畜的系统演化历史提供分子证据。【方 法】采用 PCR 产物直接双向测序法，获得普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛、沼泽型亚洲水牛和河流型亚洲水牛共 6 个物种的线粒体DNA Cyt b 基因全长序列，运用分子进化软件分析物种间的系统发育关系。【结果】6 个牛种的 Cyt b 基因序列长度均为1 140 bp，没有观察到插入/缺失突变，共检测到220 个变异位点，包含213 个简约信息 位点；Cyt b 基因序列变异中转换数明显高于颠换数，转换数和颠换数的比值为5.2，突变没有达到饱和状态。由 遗传距离可知，普通牛与瘤牛的亲缘关系最近，而它们与大额牛、牦牛、沼泽型亚洲水牛、河流型亚洲水牛的亲 缘关系依次逐渐疏远。牛亚科家畜6 个物种分布于4 个主要的单系群分支，可划归为家牛属、牦牛属、准野牛属 和水牛属；牛种间的分歧时间在 0.775—6.43 MYA，亚洲水牛与其它牛种间的分歧时间最长，普通牛与瘤牛的分 歧时间最短。大额牛和印度野牛的单系性都没有得到显现，大额牛和印度野牛在线粒体DNA 水平上不能清晰地相 互区分。【结论】中国牛亚科6 个牛种划分为4 个分支，分别对应于家牛属、牦牛属、准野牛属和水牛属，家牛属 与准野牛属、牦牛属、水牛属的亲缘关系逐渐疏远；6 个牛种间的进化分歧时间在0.775—6.43 MYA。大额牛与印 度野牛的亲缘关系非常近，两者在较早的世代具有共同的母系起源；不支持大额牛是印度野牛的家养型或驯化种 的观点，它们有可能都是现已灭绝的某种野生牛的后代。 关键词：牛亚科家畜; 细胞色素b 基因; 系统发育; 分歧时间 Phylogenetic Relationships Among Domestic Chinese Bovinae Species Based on Mitochondrial Cytochrome b Gene Sequences 1 1 2 2 2 2 GENG Rong-qing , WANG Lan-ping , JI De-jun , CHANG Hong , LI Yong-hong , CHANG Chun-fang 1 2 ( College of Life Science and Technology, Yancheng Teachers University, Yancheng 224051, Jiangsu ; College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, Jiangsu) Abstract: 【Objective 】This study was designed to analyze the p