基于蔗糖代谢基因多态性的甘蔗基因型遗传多样性.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(9): 1788-1797 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.09.004 基于蔗糖代谢基因多态性的甘蔗基因型遗传多样性 许莉萍，阙友雄，苏亚春 （福建农林大学作物科学学院/农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室, 福州 350002 ） 摘要： 【目的】探讨利用基于蔗糖代谢酶基因多态性的目标区域扩增多态性（target region amplification polymorphism, TRAP）标记进行甘蔗遗传多样性、遗传距离及遗传距离与糖分表型值关联性分析的可行性。【方 法】利用4 个根据参与蔗糖代谢酶基因SuSy、SPS、SAI 和PPDK 设计的锚定引物和9 个随机引物, 筛选具有多态 性的17 对引物组合, 对28 个糖分性状表型不同的甘蔗基因型进行TRAP 标记, 通过分子标记数据，估算不同基因 型蔗糖代谢基因的遗传变异和遗传距离, 并进行聚类分析。【结果】共扩增出170 个条带, 其中109 个为多态性 条带, 多态性比率为64.1 %, 平均每个引物组合产生10 个条带, 6.4 个多态性条带。在所测试的28 个甘蔗基因 型中, 基于蔗糖代谢酶基因多态性所估计的遗传相异系数（genetic dissimilarity, GD）为 0.12—0.80。基于 GD 的UPGMA 聚类结果显示, 在GD=0.49 处，供试基因型可被划分为4 类，但就所采集的特定时期的锤度数据而言， 类间和类内的锤度表型值没有明显的规律。【结论】甘蔗不同基因型间4 个蔗糖代谢酶基因遗传变异较高, 多态 性丰富, 暗示 TRAP 技术在评价甘蔗蔗糖分性状方面具有应用潜力, 但与锤度表型值数据的关联性还有待进一步 研究。 关键词：甘蔗；蔗糖代谢基因；目标区域扩增多态性（TRAP）标记；遗传多样性 Genetic Diversity Among Sugarcane Genotypes Based on Polymorphisms in Sucrose Metabolism Genes XU Li-ping, QUE You-xiong, SU Ya-chun (College of Crop Science, Fujian Agriculture and Forestry University/Key Lab of Sugarcane Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Fuzhou 350002) Abstract: 【Objective 】 The research objective is to evaluate the feasibility of target region amplification polymorphism (TRAP) analysis on sugarcane genetic diversity, genetic distance and the association between the genetic distance and phenotype value of sucrose content, which was based on the polymorphism of sucrose metabolism genes. 【Method 】 Four fixed primers derived from candidate genes of SuSy, SPS, SAI and PPDK involved in sucrose metabolism were used in combination with nine arbitra