水稻WRKY80转录调节蛋白基因的分离与表达模式.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(19):4035-4043 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.19.009 水稻WRKY80 转录调节蛋白基因的分离与表达模式 彭喜旭，唐新科，周平兰，胡耀军，邓小波，王海华 （湖南科技大学生命科学学院，湖南湘潭 411201 ） 摘要： 【目的】分离水稻WRKY80，分析其编码蛋白的序列结构特征，了解其在各器官中以及病原接种、激素 处理下的表达模式，为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】基于水稻基因组数据库注释的Loc_Os03g63810 基因 的编码序列设计特异引物，用 RT-PCR 法从茉莉酸甲酯（MeJA）处理的水稻叶片中克隆WRKY80 cDNA 序列，运用 生物信息学手段对推定的蛋白和启动子序列进行分析，用Northern 杂交或实时荧光定量PCR 方法研究基因的表达 模式。【结果】 获得了WRKY80 cDNA 序列，长1 392 bp，包含1 个长1 164 bp 的完整开放读码框，编码387 个 氨基酸。WRKY80 具有1 个典型的WRKY 保守结构域，锌指类型为C H ，归类于WRKY 第Ⅱ组；C-端为酸性结构区， 2 2 且含连续的6 个谷氨酰胺和8 个丝氨酸，提示具有转录激活活性；预测其定位于细胞核。WRKY80 与玉米和高粱等 单子叶植物WRKY 的氨基酸序列同一性较高。WRKY80 在各器官中组成性表达，在叶、根和穗中表达丰度较高，花 中次之，在茎和颖果中丰度较低，且表达具有发育阶段相关性，在成熟叶、根中的表达分别高于幼叶和幼根；受 稻瘟病菌、纹枯病菌、MeJA 和乙烯利诱导表达，而水杨酸对其表达无影响。其表达模式与启动子顺式元件预测分 析的结果基本一致。【结论】WRKY80 具有转录因子的结构特征，推测其可能通过茉莉酸/乙烯介导的信号途径参 与水稻的防御反应，也可能参与发育调控。 关键词：WRKY 转录因子；真菌病原；基因分离；基因表达模式；水稻 Isolation and Expression Patterns of Rice WRKY80 Transcription Regulatory Protein Gene PENG Xi-xu, TANG Xin-ke, ZHOU Ping-lan, HU Yao-jun, DENG Xiao-bo, WANG Hai-hua (School of Life Sciences, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan 411201, Hunan) Abstract: 【Objective 】 The objective of this study is to isolate rice WRKY80, to analyze the characteristics of its coding sequence and to investigate its expression patterns in different organs and under pathogen inoculation and hormone application, thus providing a basis for its function identification. 【Method 】Specific primer sequences were designed according to the annotated gene Loc_Os03g63810 released in rice genome database. RT-PCR was used