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DEPC:焦碳酸二乙酯 ①DEPC,强烈挥发性,一种潜在的致癌物质,在操作中应尽量在通风的条件下进行,并避免接触皮肤。 ②试验所用试剂也可用DEPC处理,加入DEPC至0.1%浓度,然后剧烈振荡10分钟,再煮沸15分钟或高压灭菌以消除残存的DEPC,否则DEPC也能和腺嘌呤作用而破坏mRNA活性。 ③DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。Tris溶液可用DEPC处理的水配制然后高压灭菌。配制的溶液如不能高压灭菌,可用DEPC处理水配制,并尽可能用未曾开封的试剂 DNA、RNA、蛋白质和荚膜多糖 糖苷键:一个糖半缩醛羟基与另一分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羟基、氨基或巯基所和形成的缩醛或缩酮键,常见的有O-糖苷键和N-糖苷键。 作用力:GC配对>AT配对 基因突变:为进化提供原材料,生态学 基因重组:生物多样性的重要原因之一,遗传学 多顺反子见于原核生物意指一个mRNA分子编码多个多肽链。这些多肽链对应的DNA片断则位于同一转录单位内,享用同一对起点和终点。 核糖体催化肽键合成的是rRNA,蛋白质只是维持rRNA构象,起到辅助作用。 细菌16SrRNA基因序列由保守区和可变区组成,两者互相交错排列Λ编码rRNA基因与细菌整个基因组的变化相比,有高度的保守性Λ现有细菌的RNA均由其祖先一代一代传下来,虽然在长期的进化过程中,由于不时突变而有较大变化,但其祖先的某些痕迹仍留在其核苷酸序列中,这种痕迹为细菌的系统进化研究提供了可能Λ因此,有人将rRNA称为细菌的“化石”Λ这一“化石”的存在,为细菌的研究提供了 由于核酸分子中的磷酸是一个中等强度的酸,而碱基呈现弱碱性,所以核酸的等电点比较低。(当核酸分子内的酸性解离和碱性解离相等,本身所带的正电荷与负电荷相等时,此时核酸溶液的pH值即为核酸的等电点pI)如DNA的等电点为4~4.5,RNA的等电点为2~2.5。核酸在其等电点时溶解度最小。 DNA的Tm值一般在82-95℃ 当氯化绝溶液以相当高的离心力离心时,分子沉降的倾向与分子随机扩散的相反倾向达到平衡时,将形成一种稳定的密度梯度。当把DNA放在溶液上面离心时,DNA在梯度中迁移,直到达到同自己的密度相同的部位为止,这既是DNA的浮力密度。 约占全部RNA的80%, 核糖体的主要组成部分。 rRNA的功能与蛋白质生物合成相关,可分别与mRNA、tRNA作用,催化肽键的形成。(1992年,H.F.Noller等证明23S rRNA有核酶活性,催化肽键的形成)(见蛋白质生物合成) 4.3 核蛋白体RNA的结构与功能 * rRNA的种类(根据沉降系数) 真核生物 5S rRNA 28S rRNA 5.8S rRNA 18S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA 原核生物(以大肠杆菌为例) 真核生物(以小鼠肝为例) 小亚基 30S 40S rRNA 16S 1542个核苷酸 18S 1874个核苷酸 蛋白质 21种 占总重量的40% 33种 占总重量的50% 大亚基 50S 60S rRNA 23S 5S 2940个核苷酸 120个核苷酸 28S 5.85S 5S 4718个核苷酸 160个核苷酸 120个核苷酸 蛋白质 31种 占总重量的30% 49种 占总重量的35% 核蛋白体的组成 4.4 其他小分子RNA及RNA组学 除了上述三种RNA外,细胞的不同部位存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为非mRNA小RNA(small non-messenger RNAs, snmRNAs)。 snmRNAs snmRNAs的种类 核内小RNA 核仁小RNA 胞质小RNA 催化性小RNA 小片段干涉 RNA snmRNAs的功能 参与hnRNA和rRNA的加工和转运。 4.5 RNA的功能 1、RNA在传递遗传信息上的作用 2、催化作用 3、在DNA复制、转录、翻译中起重要调控作用; 如 miRNA,siRNA等。 4、可作为遗传物质(如逆转录病毒); RNA即可为遗传物质,又可行使蛋白质的功能,故RNA在生命起源于生物进化的研究中有重要意义 RNA组学研究细胞中非信使小RNA(snmRNAs)的种类、结构和功能。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不同时间、不同状态下snmRNAs的表达具有时间和空间特异性。 RNA组学是基因组学和蛋白质组学研究的扩充、发展和延伸。 RNA组学 核酸的性质 5.1 一般理化性质 5.2 紫外吸收性质 5.3 核酸的变性 5.4 核酸的复性和分子杂交 5.5 核酸的沉降特性和浮力密度 一般理化性质 两性电解质 核酸含酸性的磷酸基团,又含弱碱性的碱基,为两性电解质,可发生两性解离; 溶解性 DNA白色纤维状固体
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