马铃薯PPR蛋白家族基因SoDIPPR的克隆及其在干旱条件下的表达特征分析.pdfVIP

中国农业科学 2008,41(8):2249-2257 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.08.005 马铃薯PPR蛋白家族基因 SoDIPPR 的克隆 及其在干旱条件下的表达特征分析 1,3 2 1 1，2 范 敏 ，金黎平 ，刘庆昌 ，屈冬玉 1 2 （中国农业大学农学与生物技术学院，北京 100094 ； 中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081 ； 3 浙江省农业科学院蔬菜研究所，杭州 310021 ） 摘要：【目的】PPR（pentatricopeptide repeat）蛋白家族在植物的生长发育、细胞器形成、细胞质雄性不 育的育性恢复、RNA 的编辑加工、细胞核与细胞器之间信号传递、逆境防御等方面具有重要作用。研究旨在了解 PPR蛋白家族 SoDIPPR基因在马铃薯中的表达情况及其在干旱胁迫下的作用。【方法】以抗旱马铃薯二倍体品系H145 为材料，利用cDNA-AFLP技术寻找与抗旱性密切相关的基因cDNA片段，利用RACE技术克隆其基因全长cDNA，并 利用半定量 RT-PCR 和 Northern 杂交法研究其在干旱条件下的表达情况。【结果】从抗旱马铃薯二倍体品系 H145 中克隆了一个836 bp全长cDNA序列，命名为SoDIPPR，该序列开放阅读框长为588 bp，编码195个氨基酸序列。 序列分析表明，SoDIPPR蛋白存在PPR结构域、激酶结合区、和C端SMR（small MutS related protein）区域。 SoDIPPR 蛋白序列与 GenBank 数据库中的其它 PPR 蛋白进行同源序列比对，构建系统进化树，发现 SoDIPPR 与其 它14个高等植物的PPR蛋白同源性为57%～82%，与苜蓿DNA错配修复蛋白MuTs2、水稻盐诱导蛋白（Q9LS25）和 叶绿体 RNA 结合蛋白（Q75IP8）的同源性达 69%～82%。半定量 RT-PCR 和 Northern 杂交结果表明，SoDIPPR 基因 在干旱胁迫下叶片和根系里的表达量明显增加，说明 SoDIPPR 基因在马铃薯抗旱中起一定作用。在持续干旱条件 下，SoDIPPR 基因在抗旱品系H145与干旱敏感品系H214中表达模式不同。【结论】马铃薯SoDIPPR 基因编码的蛋 白与其它植物 PPR 家族蛋白同源性较高，SoDIPPR 基因参与马铃薯对干旱胁迫的应答反应，可能对抵抗干旱胁迫 有一定作用。 关键词：马铃薯（Solanum tuberosum L.）；抗旱性；全长cDNA；PPR（pentatricopeptide repeat）蛋白； 克隆；表达 Cloning of SoDIPPR Gene of Pentatricopeptide Repeat (PPR) Protein Family in Potato and Analysis of Expression Characteristics Under Drought Conditions 1,3 2 1 1,2 FAN Min , JIN Li-ping , LIU Qing-chang , QU Dong-yu 1