黄牛线粒体dn d-环序列多态性与系统发育关系研究.pdf

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黄牛线粒体dn d-环序列多态性与系统发育关系研究

摘要 全序列,分析结果表明: 位点,占分析位点总数的6.48%,其中单一多态位点9个,简约信息位点50个;核苷 酸位点突变类型有五种,即转换、颠换、插,U缺失及转换与颠换共存。确定了23种 单倍型,其中单倍型H4为中国黄牛的主体单倍型,各单倍型在品种间和品种内的分 布和频率均不平衡,所测定的8个黄牛品种单倍型多样度范围从O.500~0.9444,各单 富。黄牛品种间双参数距离范围较大(0000--0.048)。群体核苷酸不配对分布曲线是 D中性检验结果均不显著 一条不规则的多峰波浪型曲线,所有序列经Tajima’S (p0.10),表明中国黄牛在过去没有出现群体扩张。黄牛不同地方品种之间存在一定 程度的基因交流,品种之间出现了显著的遗传分化。 采用黄牛mtDNA 相似,并进行拓扑结构检验,差异不显著(P0.05),表明构建的系统发育树准确。 D一环的MP树和NJ树上,明显分成欧洲普通牛型和印度瘤牛型2个分枝,表明中国 黄牛起源上含有欧洲普通牛和印度瘤牛的血统,但受普通牛的影响更大一些:对中国 黄牛是否含有斑腾牛的血统有待进一步证实。 关键词:牛系统发育遗传多样性基因流线粒体DNA控制区 Abstract DNA of50individualsfrom8 Themitochondrialcontrol regioncompletesequence resultsshowed: breeds determined.The cattle were yellow individually Chinesecattle was910 and912 yellowcomplete ofmtDNAD—loopbp,91lbp sequence were 9 sitesand50 sites 910),withsingleton bp.59 polymorphic(6.48%in polymorphic nucleotide. fivekindsofmutationof informative sites.Therewere parsimony polymorphic the oftransition were and coexistence and They transition,transverstion,insertion/deletion transvertion.Thisdefined which H4is research 23haplotypes,inhaplotypemajor of Chinese cattle.Thedistributionand ofallthe haplotypes yellow frequency haplotypes and were

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