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黄牛线粒体dn d-环序列多态性与系统发育关系研究
摘要
全序列,分析结果表明:
位点,占分析位点总数的6.48%,其中单一多态位点9个,简约信息位点50个;核苷
酸位点突变类型有五种,即转换、颠换、插,U缺失及转换与颠换共存。确定了23种
单倍型,其中单倍型H4为中国黄牛的主体单倍型,各单倍型在品种间和品种内的分
布和频率均不平衡,所测定的8个黄牛品种单倍型多样度范围从O.500~0.9444,各单
富。黄牛品种间双参数距离范围较大(0000--0.048)。群体核苷酸不配对分布曲线是
D中性检验结果均不显著
一条不规则的多峰波浪型曲线,所有序列经Tajima’S
(p0.10),表明中国黄牛在过去没有出现群体扩张。黄牛不同地方品种之间存在一定
程度的基因交流,品种之间出现了显著的遗传分化。
采用黄牛mtDNA
相似,并进行拓扑结构检验,差异不显著(P0.05),表明构建的系统发育树准确。
D一环的MP树和NJ树上,明显分成欧洲普通牛型和印度瘤牛型2个分枝,表明中国
黄牛起源上含有欧洲普通牛和印度瘤牛的血统,但受普通牛的影响更大一些:对中国
黄牛是否含有斑腾牛的血统有待进一步证实。
关键词:牛系统发育遗传多样性基因流线粒体DNA控制区
Abstract
DNA of50individualsfrom8
Themitochondrialcontrol
regioncompletesequence
resultsshowed:
breeds determined.The
cattle were
yellow individually
Chinesecattle was910 and912
yellowcomplete ofmtDNAD—loopbp,91lbp
sequence
were 9 sitesand50
sites 910),withsingleton
bp.59 polymorphic(6.48%in polymorphic
nucleotide.
fivekindsofmutationof
informative sites.Therewere
parsimony polymorphic
the oftransition
were and coexistence and
They transition,transverstion,insertion/deletion
transvertion.Thisdefined which H4is
research 23haplotypes,inhaplotypemajor
of
Chinese cattle.Thedistributionand ofallthe
haplotypes yellow frequency haplotypes
and were
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