中国水牛分子遗多样性及其起源分化的研究.pdf

摘要 我国水牛资源丰富，水牛在我国南方地区的农业生产中发挥着重要作用。为了系统研究中国 水牛的品种资源特性及其系统分类，从而为其遗传资源保护和进一步开发利用提供科学依据，本 研究采用微卫星标记、线粒体D—loop区序列和Y染色体SNP三类标记分别从全基因组、母系和 父系三个方面对中国水牛的遗传多样性和起源驯化进行了分析。 1．利用30个微卫星标记对19个中国沼泽型水牛群体、2个河流型水牛群体和1个黄牛品种 共1040份样品进行了遗传多态性检测，通过计算各种遗传多样性指标、分析群体遗传分化程度 和进行系统聚类，研究了中国水牛的群体遗传变异性和群体间遗传关系。结果表明：中国水牛具 有丰富的遗传变异性，30个微卫星座位的平均等位基因数为8．13，群体内基因多样性(期望杂合 度)为0．517．0．609，其中西南地区水牛群体的遗传变异性略高于华南和长江流域的水牛群体：但 中国水牛的总体遗传分化程度较低，群体间的遗传变异占总遗传变异的2．83％。 中国水牛各地方群体间的遗传分化和聚类关系具有明显的地理特征，据此将中国水牛分为4 大类型：长江中上游型(贵州水牛、贵州白水牛、涪陵水牛、盐津水牛、恩施水牛、和江汉水牛)、 长江下游型(海子水牛、山区水牛和东流水牛)、华南型(信丰水牛和福安水牛)和西南型(滇 东南水牛、德昌水牛、西林水牛和兴隆水牛)；峡江水牛属于长江中上游型和长江下游型间的过 渡类型，富钟水牛属于华南型和西南型间的过渡类型。德宏水牛完全不同于其它中国水牛群体而 与河流型水牛较近，分析显示该群体含有7．28％的河流型水牛血统，因此推测德宏水牛在历史上 受到了河流型水牛的基因渐渗。 2．通过测序获得了90个中国沼泽型水牛和10个河流型水牛的线粒体D．100p区序列。统计 分析表明，中国水牛的线粒体遗传变异性丰富，共发现68个突变位点，在沼泽型水牛和河流型 水牛内分别检测到45和5个单倍型，其中沼泽型水牛的单倍型可以分为swI和swlI两大母系， 分别占76．7％和23．3％；各沼泽型水牛地方群体内都包含这两个母系，但其在不同群体内的比例 变化未表现出明显的地理格局特点。分析表明swI母系经历了群体扩增，具有典型的驯化特征。 将本研究所得序列与GenBank中家养水牛序列进行联合分析，对家养水牛的起源作了推N-沼泽 型水牛和河流型水牛是单独驯化的，中国所在的东亚和印度次大陆可能分别是两种类型水牛的驯 化地点，而东南亚水牛受到了两种类型水牛的共同影响。 3．采用PCR产物直接测序方法获得了包含整个编码区在内的中国沼泽型水牛SRY基因共 义意突变G／C，沼泽型水牛为G，河流型水牛为C。在此基础上，进一步采用PCR—SSCP方法， 对我国地方沼泽型水牛和引进河流型水牛共124份样品进行了该突变的检测。结果表明：中国纯 种沼泽型水牛的SRY基因全部为突变型，而河流型水牛全部为非突变型。本研究所发现的两种类 型水牛特异的Y染色体SNP标记对评价水牛资源状况、制定保种决策、研究亚洲水牛进化历史 具有潜在重要意义。 关键词：中国水牛，沼泽型，遗传多样性，驯化，微卫星，线粒体，SRY Abstract Thedomesticbuffalo1Soneofthe mostabundantanimalresourcesinChinaand relatedto closely the inthesouthofChina．In this kindsofmolecular cropproduction study,three markers， genetic autosomal DNAandSNPonY microsatellites，mitochondrial usedto the