基因组学snp在荷斯坦青年公牛选育中的应用研究.pdf

摘要 本试验以 25 头荷斯坦青年种公牛为研究对象，以 8 个验证种公牛的各 8 头女儿共计 64 头中 国荷斯坦奶牛为参照群体，利用PCR-RFLP 检测 k-CN 基因、leptin 基因 SNP 位点；DNA 测序方 法检测 DGAT1 基因、DGAT2 基因 SNP 位点，结果共发现 7 个 SNP 位点，对 7 个 SNP 位点与中 国荷斯坦奶牛4 个生产性状进行了关联分析，并利用 7 个 SNP 的标记效应对25 头青年荷斯坦种 公牛生产性能进行了基因组估测，结果如下： 1．κ-CN Exon5扩增片段具有多态性并与产奶性状具有相关性 在被检测的中国荷斯坦奶牛中，κ-CN Exon5发现TT型、TC型、CC型三种基因型，基因型频 率分别为0.641，0.328，0.031 。三种基因型与中国荷斯坦奶牛乳脂率、乳蛋白率、体细胞数均有 显著的相关性 P＜0.05 ，其中乳蛋白率极显著相关 P＜0.01 ，与校正305天产奶量影响不显著 P ＞0.05 ；TC型在公牛选育中为优势基因型。 2 ． Lepton Exon3扩增片段具有多态性并与产奶性状具有相关性 在被检测的 64 头中国荷斯坦奶牛中，Lepton Exon3 发现 TT 型、 TC 型、 CC 型三种基因型， 其频率分别为 0.906，0.063，0.031 。不同基因型与中国荷斯坦奶牛校正305 天产奶量、乳蛋白率 均有显著的相关性 P＜0.05 ，乳脂率、体细胞数 影响不显著 P ＞0.05 ；TC 型在选育公牛中为优 势基因型。 3 ． DGAT1 Exon8扩增片段具有多态性并与产奶性状具有相关性 在对中国荷斯坦奶牛群体测序研究中，DGAT1 Exon8 发现三种基因型 AA 型、AB 型、BB 型， 频率分别为 0.594，0.344，0.062 。不同基因型对中国荷斯坦奶牛的校正305 天产奶量、乳脂率有 显著的相关性 P＜0.05 ；AB 型在选育公牛中为优势基因型。 4 ． DGAT2 Exon4扩增片段具有多态性并与产奶性状具有相关性 在对实验群体测序后发现，三个突变位点474 C/G 、481 （G/A ）、621 C/T ，各个位点发现有 两种基因型，分别为CC型，GC型；GG型，GA型；CC型，CT型，频率分别为0.484，0.516 ；0.687， 0.313 ；0.484，0.516，474 C/G 不同基因型与中国荷斯坦奶牛的体细胞数有显著的相关性 P＜0.05 ， 校正305天产奶量、乳蛋白率、体细胞数影响不显著 P＜0.05 ，CG型在青年公牛选育中是优势基 因型 ；481 （G/A ）不同基因型与中国荷斯坦奶牛的305天产奶量、乳脂率、乳蛋白率和体细胞数 无显著的相关性 P ＞0.05 ；621 C/T 不同基因型乳脂率和乳蛋白率均有显著的相关性 P＜0.05 ， 校正305天产奶量和体细胞数影响不显著 P ＞0.05 ，公牛选育中CT型是优势基因型。 5. 25头荷斯坦青年种公牛的基因组选择 通过本实验对64头中国荷斯坦奶牛4个基因7个SNP的效应的研究，对25头荷斯坦青年种公牛进 行基因组选择，结果发现s1、s2、s3、s4、s5、s6、s7、s10、s11、s13、s16、s17、s18、s19、s20、 s21、s22、s23和s24青年公牛生产性能高，s8、s9、s12、s14、s15、s17、s25公牛生产性能低。 关键词：青年荷斯坦公牛，中国荷斯坦奶牛,κ-CN基因、Lepton基因、DGAT1基因、DGAT2基因， 单核苷酸多态性，基因组选择 I Abstract The κ-CNgene、Lepton gene 、DGAT1gene 、DGAT2 gene were studied by PCR-RFLP and PCR-DNA sequencing in sixty- four Chinese Holstein cows ,whose eight daughters from eight sire family respectly. There were seven mutations, The relationship between genetic markers and four milk production traits were analyzed. The twenty-five young Holstein breeding bulls productive ability was estimated by genetic