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- 2016-03-02 发布于贵州
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松江鲈(trahidermus fasciatus)种群的形态学与遗传学研究及四种鳕鱼的遗传学研究
究及四种鳕鱼的遗传学研究
摘要
松江鲈(Trachidermusfasciatus
生二级保护动物、中国优先保护鱼类—级物种名录,于2004年被列入中国物种红色名
l℃peat)白勺:方法
录。本文利用形态学和线粒体DNA序列及ISSR(Inter-simplesequence
分别对采自丹东、秦皇岛和文登松江鲈3个群体进行了研究。
运用主成分分析、聚类分析和单因子方差分析方法对3个群体的20个量度特征和
7个分节特征进行了研究。结果显示不同群体在可数性状上除尾鳍鳍条数有差异外,
其他可数性状无明显差异;3个群体在5个量度特征匕存在显著差异,不同群体间存
在—定的差异。但这些差异属于种内不同地理群体问的差异。
利用PCR技术扩增了丹东、秦皇岛和文登3个群体线粒体DNA控制区片段,在
获得的512bp的脚序歹0中发现37个多态核苷酸变臌,86个个体具有48种单
倍型,丹东群体的DNA序列多态最丰富(1228%),遗传多样性较高,秦皇岛群体
的最低(0.538%)。群体间和群体内遗传距离相当;分子变异分析显示,松江鲈群体
间存在显著的遗传分化。利用Kimura-2模型构建的NJ树显示:各群体没有形成明显
分支。中性检验和核苷酸不配对分布揭示松江鲈经历了近期的群体扩张事件。成功扩
b基因片段中,13个个体出现了5
增了松江鲈细胞色素b序列片段,在402bp的Cyt
种单倍型,3个群体有1个共享单倍型。共发现5个变异位点,核苷酸多样性(7r)为
b基因比较保守。对松
O.3%,单倍型多样性(办)为0.628。与控制区杉0相比,Cyt
江鲈的线粒体16S
rRNA基因片段进行了扩增和序列测定,得到长度为572bp的序列
段共发现3个变异位点,4种单倍型be=0.4909,矿O.12%。其进化速率最慢,最为保守。
的遗传多样性水平高于人工繁育群体。秦皇岛人工繁育群体与丹东和文登两野生群体
16)。
明显高于这两个群体与秦皇岛人工繁育群体的基因流(0.93266;0.%1
chalcogramma)、太平洋鳕
本文第二部分选取了四种鳕科鱼类:狭鳕(Theragra
(Gadus
macrocephalus)、蓝鳕(Mzcromesistius
6S oxidasesubunit
gracilis),对其线粒体1rRNA、CytoehromeI(coo和细胞色素b(cyt
6)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过PCR扩增
和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539 rRNA)、
bp(16S
601 b),其中共检测到189处核苷酸替代,蛋白质编码基因
bp(COI)和385bp(Cyt
上的核苷酸替代主要是第三密码子位点上的同义转换。基因片段的A_盯含量都较高。
b与COI两个蛋白质编码基因的鸟嘌呤含量普遍划氐,
核苷酸组成分析结果表明,Cyt
这一点在其第三密码子位点上表现最为明显。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个
bCOI16Sb基因片段序列的分
基因片段的核苷酸替代速率依次为Cyt rRNA。cyt
析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Miocene);宽
突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在匕新世(Pliocene)。根据遗传距离构建
的-U系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。
关键词:松江鲈;形态学;线粒体DNA控制区:
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