中国玉米地方品种种族遗传变异评估.pdfVIP

中国农业科学 2015,48(16):3101-3111 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.16.001 中国玉米地方品种种族的遗传变异评估 1, 2 2 2 1, 2 3 2 2 3 2 2 刘志斋 ，吴 迅 ，李永祥 ，丁晓雨 ，王凤格 ，石云素 ，宋燕春 ，赵久然 ，黎 裕 ，王天宇 1 2 3 （西南大学农学与生物科技学院，重庆 400715 ；中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081 ；北京市农林科学院玉米研究中心，北京 100097 ） 摘要：【目的】通过 DNA 水平的分子评价，明确中国玉米 9 个种族的遗传变异，并揭示各种族之间的遗传关 系与群体分化特性，为中国玉米种族的形成与演变等相关研究奠定基础，同时也为种族资源的高效利用提供参考。 【方法】利用覆盖玉米全基因组的55个SSR 标记，对基于中国库存玉米所划分的9个玉米种族的224 份代表性材 料进行分子鉴定。获得所有标记的片段长度数据后，利用PowerMarker软件（V3.25）中的Summary模块计算224 份材料的平均等位变异、基因多样性与多态性信息含量（polymorphism information content，PIC），并通过重 取样策略，利用Wilcoxon秩和测验分析了9个种族在相同样本容量水平上3个遗传多样性参数的差异水平。利用 PowerMarker 软件中的 Phylogeny 模块计算了 9 个种族的欧氏距离，并以此进行种族的聚类分析；利用该软件中 的 Structure 模块对 9 个种族进行分子变异分析（analysis of molecular variance，AMOVA），并计算各种族的 群体分化系数（FST ），以此进行各种族群体分化检测。【结果】55个SSR 所检测到的中国9个玉米种族的等位变异、 基因多样性与PIC等3个多样性参数的幅度分别为4.42—7.64个/位点、0.5788—0.6532与0.5334—0.6117，平 均值依次为 11.53 个/位点、0.6315 与 0.5953。西南黄色硬粒种族与衍生种族的平均等位变异相对较高，但基于 重取样的分析结果表明这 9 个种族在这 3 个多样性参数上的差异均不显著（P ＞0.05）。聚类结果显示，9 个种族 分成了3个类群，其中爆裂种族形成1个独立类群，3个北方种族形成1 个类群，剩下的5个种族（3 个西南种族、 1个糯质种族、1个衍生种族）形成1个类群。AMOVA分析结果表明，9个种族之间的分子变异程度约为3%，远小 于这些种族内部所检测到的分子变异（50%）。9 个种族的群体分化系数（FST ）为 0.29%—7.63%，其中，西南白色 硬粒种族与南方糯质种族、西南马齿种族与西南黄色硬粒种族、西南马齿种族与衍生种族之间的FST 均相对较小， 分别为0.29%、0.70%与0.80%，说明其遗传关系更近。【结论】在长期的人工选择与自然选择过程中，中国玉米9 个种族蕴藏丰富的遗传变异。西南白色硬粒种族与糯质种族之间的分化程度远低于其他种族，前者在糯玉米资源 的起源进化中可能扮演重要角色；西南黄色硬粒种族和西南马齿种族与衍生种族之间的分化程度很低，表明这 2 个种族对衍生种族的形成可能有重要作用。 关键词：玉米；种族；SSR；遗传变异 Assessment of Genetic Variation in Different Races of Maize Landraces in China 1, 2 2 2