多态性及疾病关联应用研究及meta的分析.ppt
累积meta分析 敏感性分析 Meta回归分析寻找研究异质性来源 本文欣赏结束 * 红藕香残玉簟秋,轻解罗裳,独上兰舟。 云中谁寄锦书来?雁字回时,月满西楼。 谢谢欣赏!! * * * 单核苷酸多态性与疾病关联研究及利用Stata软件进行Meta分析 金飞 SNP 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)是基因组突变最常见的形式,是指单个碱基(A, T, C, G)的替换。 包括转换(同类碱基间的变化,如A/G,C/T)和颠换(不同类型碱基间的变化,如A/C,G/T)。 tagSNP 狭义的SNP指次等位基因频率(minor allele frequency, MAF)大于0.01的单碱基突变。 广义SNP包含MAF小于0.01的单碱基突变。在NCBI数据库dbSNP中注册的广义SNP超过1300万个。 常见SNP(common SNP)指MAF大于0.05的SNP,估计在人类基因组中大于700万个。 人类基因组-马赛克样结构 现在,被dbSNP数据库收录的每一个SNP均会被分配给一个不重复的,以rs加上阿拉伯数字组成的号码,如rs2120243。 检索SNP最常用的网站是dbSNP数据库:/projects/SNP和HapMap网站: HapMap计划 由于人类基因组中SNP太多,目前直接测序价格昂贵
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