MRIcron、SPM5、xjView的安装与介绍,用SPM5进行预处理、个体统计与群体统计.pdf

Lab1 常用数据处理软件的安装和介绍 实验内容 Matlab 7.1 介绍 主界面 基本命令 SPM5 安装以及界面，功能介绍 安装 界面 大致功能 MRIcron 基本使用方法 安装 图像显示 DICOM 数据格式转换 所需软件 1. Matlab (version: 7.1 R14) 2. SPM5 (updates_958) 3. MRIcron (version: beta 7) Matlab 7.1 介绍 1. Matlab 主界面 在所有实验中，我们都将使用Matlab 7.1 软件包 (The MathWorks, Inc.) 。在 安装完毕后，双击快捷方式图标打开Matlab 。点击Matlab 窗口上方的View 菜单， 勾选Command Window, Command History, Current Directory 和Workspace 。这时， Matlab 将呈现四个子窗口： 1) Command Window ：位于右下方。即指令窗口，是键入指令的地方，也是Matlab 显示计算结果的地方； 2) Command History ：位于左下方。即历史命令窗口，存放历史输入命令； 3) Current Directory ：位于左上方。即当前工作目录，显示当前目录下的文件信息； 4) Workspace ：位于右上方。即工作空间，存放变量在内存中。 Fig.1 就是Matlab 的标准工作界面，上述四个子窗口可以自由拖动改变位置。 Fig.1 Matlab 7.1 的主界面 此时，Matlab 处于准备接受命令的状态，可以在命令窗口（右下方的子窗口） 中直接输入命令语句。 2. Matlab 基本命令 1. 设置当前工作路径 (current directory) 1) 在Windows 下建立一个新文件夹，如： D:\work\dicom_convert\ 2) 在Matlab 的指令窗口中键入： cd ‘D:\work\dicom_convert\’ 这样，就将Matlab 的当前工作路径设置在上述路径下了。 3) 在Matlab 的指令窗口中键入：“pwd ”，然后回车 4) 这时，Matlab 的指令窗口中显示出当前工作路径信息： ans = D:\work\dicom_convert\ 2. 添加搜索路径 (set path) 1) 点击Matlab 最上方的“File ”菜单，在下拉菜单中选择“Set Path ” Add with Subfolders ”，浏览并点选目标文件夹 2) 在弹出的路径设置窗口中选择 “ （如Fig.2 所示），然后点“确定” 3) 点击 “Save ”按钮 4) 检查该路径是否添加到右侧的搜索路径列表中 5) 点击 “Close”按钮 Fig.2 添加搜索路径 3. 其他常用命令及功能 1) load 载入变量到内存 2) clear 清除内存中所有的变量 3) clc 清屏 4) exit 退出Matlab 5) helpwin 打开帮助窗口 SPM5 介绍和安装 SPM5 是一款功能强大的神经影像计算软件，由 Wellcome Department of Imaging Neuroscience 小组开发，可以对PET, EEG, fMRI 等图像进行处理。对fMRI 数据的处理可以由预处理，个体统计分析，组分析来实现。将SPM5 程序解压缩 后，得到一个名为“spm5 ”的文件夹，文件