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中南大学生物科学技术学院.doc
中南大学生物科学与技术学院
分子生物学研究中心
教 案
授课科目: 授课内容:授课对象:临床医学年制年制授课时数:学时授课:授课地点:授课时间:多媒体教学多媒体课件 有聚合酶活性, 3ˊ→5ˊ核酸外切酶活性, 5ˊ→3ˊ核酸外切酶活性。
2. DNA聚合酶Ⅰ大片段
DNA聚合酶Ⅰ大片段(large fragment of DNA polymerase I)为DNA聚合酶I用枯草杆菌蛋白酶(subtilisin)裂解后产生的大片段,这个片段也称为Klenow片段(Klenow fragment)。
有5ˊ→3ˊ聚合酶活性, 3ˊ→5ˊ核酸外切酶活性, 无5ˊ→3ˊ核酸外切酶活性
Klenow片段的主要用途有:
(1) 补齐双链DNA的3ˊ末端。
(2) 通过补齐3ˊ端,使3ˊ末端标记。
(3) 在cDNA克隆中,第二股链的合成。
(4) DNA序列分析。
3. 逆转录酶(reverse transcriptase)
是一种RNA依赖的DNA聚合酶,即以RNA为模板合成DNA,合成时需要四种脱氧核苷酸及3ˊ-OH引物,合成方向为5ˊ→3ˊ延伸,无3ˊ→5ˊ外切酶活性。广泛用于以mRNA为模板合成cDNA,构建cDNA文库。
4. T4 DNA连接酶(T4 DNA ligase)
T4 DNA连接酶催化双链DNA一端3ˊ-OH与另一双链DNA的5ˊ端磷酸根形成3ˊ→5ˊ磷酸二酯键,使具有相同粘性末端或平端的DNA两端连接起来。
5. 碱性磷酸酶(alkaline phosphatase)
能去除DNA或RNA 5ˊ端的磷酸根。制备载体时,用碱性磷酸酶处理后,可防止载体自身连接,提高重组效率。
6. 末端脱氧核苷酸转移酶
末端脱氧核苷酸转移酶(terminal deoxynucleotidyl transferase, TdT),简称末端转移酶。它的作用是将脱氧核苷酸加到DNA的3ˊ-OH上,主要用于探针标记;或者在载体和待克隆的片段上形成同聚物尾,以便于进行连接。
第二节 基因克隆的载体
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果将其直接导入宿主细胞,没有有效的方法将导入了外源DNA片段的细胞和没有导入外源DNA的细胞区分开来。此外,外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细胞的繁殖而复制,即没有自主复制能力,达不到使外源DNA片段扩增的目的。如果要将外源DNA片段导入宿主细胞进行扩增或表达,就需要有一个能在该宿主细胞内进行自我复制和表达的载体(vector)来携带。外源DNA片段与载体在体外连接,构成重组分子,然后导入宿主细胞,使之进行扩增或表达。
一、质粒(plasmid)
质粒是存在于多数细菌和某些真核生物染色体外的双链环状的DNA分子。
质粒含有复制起始点,此复制起始点与其他一些顺式调控因子构成复制子,能利用细菌染色体DNA复制和转录的同一套酶系统,在细菌体内独立地进行自我复制及转录。
作为克隆载体的质粒应具备下列特点:
(1)分子量相对较小,能在细菌内稳定存在,有较高的拷贝数。
(2)具有一个以上的遗传标志,便于对宿主细胞进行选择,如抗生素的抗性基因,β-半乳糖苷酶基因(Lac Z)等。
(3)具有多个限制性内切酶的单一切点,便于外源基因的插入。如果在这些位点有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。
质粒一般只能容纳小于10kb的外源DNA片段。
二、λ噬菌体
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌的病毒, 用作克隆载体的噬菌体有两种:一种是λ噬菌体,另一种是M13噬菌体。
野生型λ噬菌体经过改造,已衍生出100多种克隆载体。 λ噬菌体载体分为插入型和替换型(置换型)两类。
目前应用较广的是EMBL系列、λgt系列和Charon系列等。
λgt10和λgt11载体适用于建立cDNA文库。这两个载体都属插入型载体,能克隆7kb以下的外源DNA。 λgt11为表达型载体。
三、粘性质粒(cosmid)
粘性质粒是由λ噬菌体的噬菌体的粘性末端(cos区)与质粒重新构建的载体,为双链、环状DNA。其克隆容量可达40~50kb。
四、M13噬菌体
M13噬菌体(M13 phage)是一种大肠杆菌雄性特异丝状噬菌体,全长约6.5kb。M13感染细菌后,经过复制转变为双链的复制型(RF)。复制型M13可用作克隆载体。
当每个细菌体内的复制型M13拷贝数积累到100~200后,M13的合成就变得不对称,只有其中一条链进行复制,产生大量的单链DNA,并被包装到成熟的噬菌体颗粒中,然后从细菌中排出。M13噬菌体的最大优点在于从细菌体
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