百子莲CONSTANS同源基因的克隆及表达分析.pdfVIP

第36卷摇 第4期 北 京 林 业 大 学 学 报 Vol.36,No.4 2014年7月 JOURNAL OF BEIJING FORESTRY UNIVERSITY Jul. ,2014 DOI:10.13332/ ki.jbfu.2014.04.021 百子莲CONSTANS 同源基因的克隆及表达分析 1 2 2 1 1,3 石玉波摇 张摇 荻摇 申晓辉摇 王摇 玲 摇 卓丽环 (1东北林业大学园林学院摇 2 上海交通大学农业与生物学院摇 3 上海农林职业技术学院) 摘要:根据前期百子莲转录组测序分析的结果,获得了1个与光周期调控开花途径关键基因CONSTANS(CO)同源 性较高的核心片段。 采用 cDNA 末端快速扩增(RACE)方法得到了百子莲 CO 基因cDNA 全长序列,命名为 ApCOL,GenBank登录号为KF683287。 序列分析表明,百子莲ApCOL基因cDNA全长1648bp,5忆非编码区(5忆UTR) 和3忆非编码区(3忆UTR)分别为 126 和355 bp,开放阅读框(ORF,127 ~1293 bp)1 167 bp,编码 388 个氨基酸。 ApCOL具有CO蛋白典型的结构域:氨基末端有2个B鄄box结构域,羧基末端有1个CCT保守结构域。 氨基酸同源 性比对发现,ApCOL与葡萄(XP_002274384郾2)、可可(EOX99181郾1)和大豆(NP_001241023郾1)等植物的CO蛋白有 很高的相似性,同源性均在50%以上。 系统进化树分析表明,ApCOL与小麦CO(EMS51329郾1)聚类关系最近。 实 时荧光定量qRT鄄PCR结果表明:叶片中ApCOL 的表达量在花芽分化3个时期均高于花芽中的表达量,且叶片中的 最高表达量和花芽中最低表达量均出现在花芽诱导期;在整个初花期内,各器官中ApCOL 表达量由高到低依次是 花梗、叶片、幼果、子房、花瓣、茎和花葶,花梗中表达量分别为叶片和茎中的2郾68和114郾3倍;不同光周期处理的叶 片中ApCOL基因表达模式相近,均在暗处理时期呈现高表达。 说明该基因的表达具有明显的时空差异性和生物钟 调节特性,推测ApCOL在百子莲成花过程中以及花发育过程中发挥着一定的作用。 关键词:百子莲;ApCOL;克隆;基因表达 鄄鄄 鄄鄄 鄄鄄 中图分类号:S682摇 摇 文献标志码:A摇 摇 文章编号:1000 1522(2014)04 0113 08 1 2 2 1 1,3 SHI Yu鄄bo ;ZHANG Di ;SHENXiao鄄hui ;WANGLing ;ZHUOLi鄄huan . Molecular cloning and expression pattern analysis of a CONSTANS homolog from Agapanthus praecox ssp. orientalis. 鄄鄄 Journal of Beijing Forestry University (2014)36(4) 113 120 [Ch,21ref.] 1College of Landscape and Architecture,Northeast Forestry University,Harbin,150040,P.R.China; 2 School of Ag