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第十一章 RNA的生物合成(转录) RNA Biosynthesis, transcription 1、原核生物转录的模板和酶 2、原核生物的转录过程 3、真核生物的转录过程 4、真核生物RNA的加工 转录的概念 转录:是指在RNA聚合酶催化下,以DNA的模板链为模板,4种NTP为原料,按碱基配对规律(T-A,A-U,G-C)合成一条与模板链互补的RNA链的过程。 转录与复制的异同点 相同之处 酶促的核苷酸聚合过程 以DNA为模板 需依赖DNA的聚合酶 形成磷酸二酯键 延伸方向一致 遵从碱基配对规律 不同之处 第一节:原核生物转录的模板和酶 转录模板 RNA聚合酶 RNA聚合酶如何启动转录 一、转录模板 细胞内DNA不是其全长都可作为转录模板 ,能转录出RNA的DNA区段,称为结构基因(structural gene)。 DNA双链中,能作为模板转录出 RNA 的一条链,称为模板链(或反意义链)。 同一DNA双链中与模板链相对(互补)的一条链称为编码链(或有意义链),可见转录是不对称的 。 模板链=反意义链=负链 编码链=有意义链=正链 不对称转录 不对称转录:是指在一个包含多个结构基因的双链DNA分子中,只有模板链转录,而且各结构基因的模板链并不总是存在于一条链上,在某个基因中以这一条链为模板,在另一个基因中则以另一条链为模板,这种转录现象称为不对称转录。 二、RNA聚合酶 特点: 1.以四种三磷酸核苷酸(NTP)作为原料: 2.遵循碱基配对原则: A-U,T-A,C-G; 3.RNA链的延长方向是5’→3’的连续合成。 3.不需要引物。 4.缺乏3’→5’外切酶活性,所以没有校正功能。 原核生物RNA 聚合酶 全称为依赖DNA的RNA聚合酶 (DNA-dependent RNA polymerase , DDRP) 原核生物(E.Coli)的DDRP 由 5 个亚基组成 α2ββ’(核心酶) +σ因子 σα2ββ(全酶) 四种亚基的功能分别为: α亚基:决定哪些基因被转录。 β亚基:含催化部位,起催化作用,催化形成磷酸二酯键,与转录全过程有关。 β’亚基:与DNA模板结合,解开双链。 σ亚基:识别起始位点,结合启动子。 不同的σ因子识别不同的启动子,从而表达不同的基因。 不同的原核生物,都具有相同的核心酶,但σ亚基有所差别,这决定了原核基因表达的选择性。 利福平或利福霉素是原核生物RNA-pol的特异性抑制剂,特异性结合β亚基。 三、模板与酶的辨认、结合 操纵子:原核生物DNA分子中的每一个转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子。 结构上包括两个功能区:结构基因、调控序列(启动子、操纵基因、终止辨认子和调节基因等)。其中启动子是RNA聚合酶辨认、结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 RNA聚合酶保护法。 起始位点的识别 σ识别正确的启动子,启动子的结构由三部分组成: -35区 TTGACA提供了RNA聚合酶全酶识别的信号,辨认结合后,酶向下游移动,达到Pribnow盒(-10区 TATAAT); -10区序列是酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开);第三部分是RNA合成的起始点。 第二节:原核生物的转录过程 起始 延长 终止 一、转录起始 1. RNA聚合酶准确地结合在转录模板的起始区域。 2. DNA双链解开,其中的一条链作为转录的模板合 成第一个磷酸二酯键。 转录起始复合物:启动子、全酶和第一个磷酸二酯键形成的复合物称为三元起始复合物。 二、转录延长 三、转录终止 依赖Rho (ρ)因子的转录终止 非依赖Rho因子的转录终止 依赖?因子的转录终止 第三节:真核生物转录过程 原、真核生物RNA聚合酶间的比较 转录起始 (一)转录起始前的上游区段 包括转录起始点及其上游约100-200bp序列,由若干具有独立功能的DNA序列元件(顺式作用元件)构成,每个元件约长7-30bp。 顺式作用元件 顺式作用元件:是指存在于真核生物DNA分子上的,能影响自身基因表达活性的DNA序列。 (二)转录因子 能直接或间接辨认和结合转录上游区段DNA的蛋白质,通称为反式作用因子(trans-acting factors)。 其中能直接或间接结合RNA聚合酶的称为转录因子(transcriptional factors,TF),又称为通用转录因子或基本转录因子。 分类:TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ 参与RNA-pol Ⅱ转录的TFⅡ 转录延长 真核生物转录延长过程与原核生物大致相似, 但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。 核小
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