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亚麻EST-SSR标记开发.pdf
第43卷第4期 东北农业大学学报 43(4):7扣79
of 2012
2012年4月 JoumalNonheast April
A—cul£uraIUniVe嵋ily
亚麻EST—SSR标记开发
苏 钰,李 明+,姜 硕,郑东泽
(东北农业大学农学院,哈尔滨15∞30)
量和冗余序列后,筛选得到舍有ssR的序列共239条,检出率为3.0%。其中二核苷酸重复49务,共7个重复类
型;三核苷酸重复160条,共41个重复类型;四核苷酸重复30条,共11个重复类型。根据不同的重复类型共设
晰且具有多态性,占设计引物的49.2%,通过聚类分析可将20份亚麻材料划分为五大类.验证了EsT—ssR分子标
记在亚麻遗传多样性分析中应用的可行性。
关键词:亚麻;EST—SSR;分子标记
文献标志码:A
中图分类号:s435.63;Q949.9
of usjfatfssimum marker传u
fIax(Ljnum L.)EST—SSR Yu。LI
DeVeIopment
Shuo,ZHENG of ricuIture,NortheastUniVersity,Har.
Ming,JlANG Dongze(Co¨egeAg AgricuIturaI
bin150030,China)
Abstract:A的tof7947EST fromNCBlwe怕usedinorderto the怕soun∞
sequen∞s deveIop
offlaxESl--SSR.AfIer239EST·SSRshadbeen 3.O%0f
IOtaI,
assembly Obtained,represenling
Di—nucIeOlideof7 60Tr..nucIeotideof41 and30Tetra-nucleo-
49
incIuding repeattypes,1 repeattypes
tide0f11 frOmthe65 EST-SSRrimersshOwed
repeattypes.52primefpairs designed p ampl币cationby
PCR in20们axaOcessions.32 cIearbandswith
asuitabIe pairsampIify high
system pOIymorphism,
49.2%Oftotal rimers.20门axaccessionscouIdbediVidedintO们Ve
representing desIgnedp gn)upsby
basedonE
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