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有一些差异对人体有无害的差异。例如,人外观的不同。 有一些差异会给人体带来有害的变化,称为变异。通常位于编码序列或调控序列。造成重要蛋白质功能的改变,导致疾病。 单基因病:单个基因的变异导致疾病发生。如血友病。 多基因病:需多个基因的变异才能导致疾病的发生。如糖尿病,心脏病,癌症等。 有一些差异会带来潜在的变化。它们的效果只有在特定的条件下才能显现出来。 这种差异可能决定人在特定环境因子影响下对疾病的易感性。另外还可能决定在患病后对治疗的反应性。 单核苷酸多态性(SNP) 是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。 SNP在人基因组中的发生频率比较高,是最常见的基因组差异。 SNP和人类的健康有着密切的关系。 SNP SNP发生在全部人群的至少1%的人中。 SNP在基因组中数量繁多(几百万个),易于检测,有很大的实用价值。 大多数SNP位于非编码序列,不影响基因功能。有些SNP位置靠近特定的基因,可作为基因的标志。 其它的SNP位于编码序列内,可改变基因表达的蛋白质,从而影响人类健康。 多肽链是由氨基酸连接而成的。氨基酸具有不同的化学性质。 多肽链须折叠成蛋白质的立体结构才能发挥正常的功能。如果多肽链中一个或多个氨基酸发生了改变,则蛋白质折叠和功能可能会发生改变。 有些SNP尽管位于编码序列内,但并不改变蛋白质的组成。 例:CUG—CUC亮氨酸 有些SNP会给蛋白质带来微小而无害的影响。 例:GAU—GAG 天门东氨酸变成了谷氨酸。两者都是酸性氨基酸。如果发生位置对蛋白质功能影响不大,结果就是无害的。蛋白质还会发挥正常的功能。 有些SNP会给蛋白质的功能带来有害的影响,称为变异。 例:GUA—GUU 天门东氨酸变成缬氨酸。由于化学性质完全不同,会严重地影响到蛋白质的折叠和功能。 镰刀形红细胞贫血症 血红蛋白基因中单个碱基的改变导致谷氨酸被缬氨酸取代。变异的血红蛋白不能再携氧,导致疾病。 有些SNP带来的影响在一般情况下不显现,只有在身体暴露在致病因子时才显现。因为这些SNP所在的基因负责调节有害因子的吸收,代谢,排泄等。基因的微小变化会影响人体对疾病的易感性。 例:吸烟—肺癌,过量饮酒—肝癌。 当人吸烟时,致癌因子的前体进入肺部细胞内。激活蛋白会将致癌因子的前体转变成致癌因子。致癌因子会被解毒蛋白变成水溶性物质并经尿排出体外。 位于激活蛋白基因内的SNP会影响激活蛋白的活性。 有些人的激活蛋白活性超强,可以在肺部产生大量的致癌因子,损害细胞的DNA,导致癌症。 有些人的激活蛋白活性超弱,产生的致癌因子较少,患癌症的可能性较低。 SNP还会影响解毒蛋白的活性。 有些人的解毒蛋白活性超强,可以很快将致癌因子排出体外。患癌症的可能性较低。 有些人的解毒蛋白活性超弱,将致癌因子排出体外的速度慢。患癌症的可能性较高。 在染料厂工作的工人会经常接触芳胺,患膀胱癌的可能性较高。 肝脏中有两种酶可作用于芳胺。一种是解毒酶,将芳胺转变成无毒物质并排出体外。另一种是激活酶,可将芳胺转变成致癌因子的前体,并转运至膀胱,可致膀胱癌。 SNP会影响解毒酶的活性。有些人的解毒酶活性较低,将芳胺转变成无毒物质的速度较慢。较多的芳胺会被转变为致癌因子。这些人患膀胱癌的可能性较高。 但即使在解毒酶活性较低的人当中,并不是每个人患膀胱癌的可能性都很高。 在美国,约50%的人解毒酶活性较低,但500人中只有一人患膀胱癌。可能还有其它的基因会影响人类患膀胱癌的几率。 疗效及副作用的个体差异。控制药物的吸收,转运,代谢,排泄等环节的蛋白SNP。 例:将药物转变成有效成分的蛋白及将药物转变成有毒副产物的蛋白。 解释疗效及副作用。 SNP数量众多,稳定及易于检测。用作基因的标记。 如SNP位于基因的附近并随基因一起遗传。发现了SNP就等于发现了基因。 科学家们正对很多人的基因组进行大规模的测序,以找出所有的SNP,并绘制SNP的地图。应用。 每个人都有他自己的SNP类型。 根据SNP类型将一个大的人群分为小的群体。 不同SNP类型的人对治疗的反应不同。 将来,在确诊后,根据患者SNP类型来确定治疗方法。 SNP类型还有助于发现疾病基因。 只在疾病患者上发现的SNP是疾病基因的标记。 有的SNP在基因附近,通过SNP可发现疾病基因。 SNP类型还有助于发现患病的危险性。 例:在随机抽取的100正常人中,80人有SNP A,20人有SNP B。而在100个肾癌患者中,60人有SNP A,40人有SNP B。 SNP B的人患肾癌的危险性比SNP A的人高。 通过SNP地图,研究SNP与疾病易感性,治疗有效性(药物反应性,抵抗性)等的关系。 生活方式的干预(吸烟,饮酒),适当疗法的选择。 癌肿基因组解剖学计划研究在基因组内发生的变化。 在癌症细胞中,基因会发生突变
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