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翱翔科技服务中心 2005 年8 月12 日制作
二、立论依据
(包括项目的研究意义、国内外研究现状分析,并附主要参考文献及出处。)
对基础研究,着重结合国际科学发展趋势,论述项目的科学意义;
对应用基础研究,着重结合学科前沿、围绕国民经济和社会发展中的重要科技问
题,论述其应用前景
1. 电子信息杂交策略及其在猪基因组研究中的应用现状
电子信息杂交策略是依据比较基因组定位结果,充分利用猪 EST (expressed
sequence tag, EST )数据库的信息资源,借助计算机辅助进行基因的克隆,又称为
“silicon cloning ”。其基本原理是利用研究深入、标记稠密的哺乳动物基因组保守功
能基因的编码区序列(CDS )作为信息探针,在猪 EST 数据库筛选同源 EST(s)(标准:
长度≥100bp,同源性 75%~95%) ,排除已克隆 EST(s)后进行拼接,设计引物获取基
因(cDNA) 全长(Altschul 等,1990;Mao 等,1998;A 田芳等,2000 ;Cirera 等,
2000 )。该方法的特点是:(1)是建立在生物信息学分析的基础上,进行同源性比较
和计算机辅助克隆新基因,具有快速、简便、直接等优点;(2) 因为该方法在选择候
选基因时有很强的目的性,是一种与定位克隆、定位候选克隆策略并列的比较候选基
因法;(3 )由于该方法是利用的是 EST 即 cDNA 部分序列信息,因而能够获得基因
(cDNA) 全长(Liang 等,2000 )。
利用电子信息杂交策略在分离猪基因中的应用才刚起步(Cirera 等,2000 ),但
该方法在人及其它动物基因分离中已经有广泛的应用(Mao 等,1998;Bolognese, 等,
2000 ;毕安定等,2000 ;范玉新等,1999),由此可见,利用电子信息杂交策略分离
猪基因将具有良好的应用前景,在国内开展十分必要。
2. 猪 12 号染色体上基因及遗传与物理的研究现状与不足
12 号染色体是猪基因组中最小的中部着丝粒染色体,1999 年 2 月22 日申请者在网上检索
到的猪 12 号染色体上遗传与物理图谱现状如图 1、图2、图3。收录到猪 12 号染色体上的基因
和标记共 57 个,其中功能基因 26 个,微卫星标记 31 个。功能基因有:ALOX12 (二十碳四稀
酸-12-脂氧合酶,arachidonate 12-lipoxygenase );CDC42 (GTP 结合蛋白,porcine EST, GTP
binding protein );EAD (红细胞抗原D,erythrocyte antigen D );GH1 (生长激素,growth hormone );
HOXB6 (同源框B6,Homeobox gene B6 );NME1 (Nm23 protein );INHBB (抑制素β亚基,
Inhibin, beta subunit );KICT (细胞骨架角蛋白类型I,Keratin type I, cytoskeletal );MCP (单核
苷酸趋化蛋白,Monocyte chemoattractant protein );PRKAR1A (cAMP 依赖性蛋白激酶调节亚
单位类型 1A ,cAMP-dependent protein kinase regulatory type1 alpha );POLR2 (大多肽 RNA 聚
合酶Ⅱ,large polypeptide RNA polymerase II) ;TK1(可溶性胸苷激酶 1,thymidine kinase 1,
2
soluble);TP53 (肿瘤蛋白 53, tumour protein p53);UMPH2 (尿苷酸磷酸水解酶
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