不同地理种群二化螟Ty3gypsy反转座子天冬氨酰蛋白酶（AP）基因序列的克隆与分析.pdfVIP

昆虫 学 报 不同地理种群二化螟 反转座子天冬 氨酰蛋白酶基因序列的克隆与分析 李晓欢 罗光华 韩召军 方继朝 江苏省农业科学院植物保护研究所南京 南京农业大学植物保护学院南京 摘要 目的反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子 反转座子上的天冬氨酰蛋白酶 基因是反转座子发生转座所需的一个重要基因 但由于该基因家族成员间变异较大较难利用简并引 物克隆得到该基因所以对该基因家族成员的研究很少 方法本研究采用方法克隆了二化螟反转 座子的基因序列并对其序列特征和地理种群变异进行了分析 结果克隆获得的二化螟 反转座子中的基因具有独立的开放阅读框 长 编码的蛋白 含 个氨基酸残基 登录号 在线工具分析显示该蛋白中含有一个 特异的 保守功能域 从 个二化螟不同地理种群中共克隆获得 份基因拷贝 对同一基因座位 上的序列多重比对分析发现共存在 处碱基替换其中碱基转换 有 处碱基颠换 有 处 份拷贝中有 份拷贝是完整的能编码完整的蛋白 从碱基替换形式看 的变异形式出现最多 有 处其次是 的变异形式有 处其余的变异形式都很少 对比这 个不同地理种群没有发现碱基的替 换存在明显的地理区划差异 结论碱基的替换形式与二化螟所处的地理区域无明显相关性 本研究对于认识反 转座子序列的变异特点有所帮助 关键词 二化螟 反转座子 天冬氨酰蛋白酶 基因克隆 序列分析 中图分类号 文献标识码 文章编号 基金项目 国家水稻产业技术体系项目 国家自然科学基金项目 江苏省农业科技自主创新资金项目 作者简介 李晓欢 女 年生 辽宁辽阳人 硕士研究生 研究方向为昆虫分子生物学 罗光华 男 年 生 江苏溧阳人 博士 副研究员 研究方向为粮食作物虫害 共同第一作者 通讯作者 收稿日期 接受日期 期 李晓欢等 不同地理种群二化螟反转座子天冬氨酰蛋白酶基因序列的克隆与分析 转座子是一段序列能够不依靠同源重组 该蛋白酶家族成员 现在已报道的该蛋白酶家族成 而在宿主基因组内移动 起初转座子被认为是垃圾 员大多数是借助于生物信息学工具从各种类型的数 序列在宿主体内无生物学功能 据中发掘得到的 反转 但现在已经明确转座子是宿主基 座子所编码的天冬氨酰蛋白酶 其在反转座子 因组的重要组成部分是宿主进化的重要内在动力 内部可以是一个独立的也可以与反转录酶 之一 酶