候选基因多态性慢性苯中毒的关联分析研究.pdf

复旦大掌博士掌位论文 中文摘要 候选基因多态性与慢性苯中毒的关联分析研究 苯主要通过其代谢产物引致接触者的血液毒性和遗传毒性。慢性苯中毒的发 生存在着遗传易感性。代谢酶基因、DNA损伤修复基因、细胞周期调控基因的 多态性与慢性苯中毒遗传易感性的关系，本课题组已进行了多次单独的研究探 讨。 我们在研究中注意到以下几个问题：①以往的研究结果是建立在对苯的代 谢、DNA损伤修复、细胞周期调控分别进行分析的基础上得到的。由于苯中毒 的发生与以上3个方面均可能有关，如果仅分析某一机制的作用，则可能使研究 结果产生偏倚。②单个SNP的作用可能是非常微弱的，研究者在进行统计分析 时，需要考虑SNP的交互作用。但是，当样本量固定，而研究的SNP个数逐渐 增多，在考虑交互作用时，则估计的参数呈指数形式增加，进行Logigic回归会 导致非常大的估计偏差。③在所研究的候选基因多态中，哪些对苯中毒发生的影 响比较大，哪些有潜在的影响，目前还不明确。应该选取重要的变量来预测苯中 毒发生的概率，从而提高预测的准确性。 针对上述问题，本次研究在职业流行病学调查和实验室研究的基础上，综合 分析了候选基因多态与慢性苯中毒的关联，包括基因的主效应、基因与基因的交 互作用、基因与环境因素的交互作用。分析策略主要为：①在单个位点分析时控 制多重检验的阳性错误发生率(FDR)，并筛选SNP用于Logistic回归模型，以分 析主效应和2阶交互效应；②控制吸烟等混杂因素的影响，分析单体型与慢性苯 中毒之间的关联：③采用数据挖掘中的多因子降维法(MDR)进一步分析高阶 Forest)分析各个SNP影响苯中毒发生的重 交互作用；④采用随机森林(Random 要性，并根据重要性评分，筛选相对重要的SNP以利今后进一步研究。 为探讨候选基因多态性与慢性苯中毒的关联，我们开展了病例一对照研究， 病例组为152名苯中毒工人，对照组为152名调查时正在从事接苯作业而没有慢 性苯中毒表现的工人。采用Dosmeci等的接触评估方法，对研究对象的累积接触 水平进行了评估，并调查了他们吸烟、饮酒等情况。职业流行病学调查结果表明， 病例组和对照组的一般特征如性别、民族、年龄、工龄和累积接触评分在两组人 群中的分布无统计学差异，表明病例组和对照组均衡可比。 复旦大爿时●士掌位论文 中文摘要 根据苯中毒的发生机制，检测了3类基因的SNP。代谢酶基因：CYP2EI、 周期调控基因：删、刀J『、mdm2、gadd4如、川一时，共13个SNP。通过排除 未检出变异基因型的以及严重偏离HWE的SNP，最后共有51个SNP用于关联 研究(代谢酶基因、DNA损伤修复酶基因、细胞周期调控基因分别有33个、10 个、8个SNP)。 由于SNP个数较多，在进行Logistic回归时考虑交互作用的策略如下：首 先筛选出单变量检验P值小于0．05的SNP作为自变量，环境因素为协变量；再 用FonⅣ删法建立Logi疏回归模型分析各SNP的主效应、2阶交互作用；最后， 将以往研究得出的无主效应但有交互作用的SNP及其交互项也纳入到Logistic 回归模型(Bac删法)中，分析其在新的模型中是否还存在交互作用． Logistic回归分析结果如下。①未检测到主效应的有以下40个SNP。代谢 所有4个SNP； rs2234922、幅105174l、 NQOl塔1131341、搭1800566：EPHXl 璐l rsl DNA损伤修复基因：XPDrsl318l；A陀J 的璐l13“10：．妆0∞的rS861539。细胞周期调控基因：筇3的所有3个SNP： 斛646903；C脚D610佟1065852和鸭l135840。DNA损伤修复基因：胁打聊 细胞周期调控基因：矿J『 1059234．③检出的交互作用有如下10种：CYP2EI rS38l3867与EPHXI 饮酒；CyPIAI XRCCJ『rsl799782与APEJ『倦1130409；APEJ『髂1130409与饮酒；嬲J『 1799793。 rsl052133与XPD 与以往研究结果不同的是：①本次研究新检测出了