生物小分子及模型分子在溶液中相互作用及质子转移的研究.pdf

摘要 摘要 质子转移在众多化学反应和生命过程中发挥了重要的作用，生物分子内的 质子转移造成的互变异构现象是生物体发生点突变的起因之一。众所周知，生 物分子大都是在溶液尤其是水溶液中才具有特定的生理活性，因此对生物分子 质子转移反应的研究不能脱离对其自身所处环境的考量，即需要了解生物分子 在溶液中的相互作用。相互作用是生物分子体系中普遍存在的一类重要作 用，在分子组装、分子识别及决定结构一功能一活性关系等方面有着及其重要 的作用，其本身就是一个非常有趣的命题。本论文拟从简单的生化模型小分子 出发，从研究其在水溶液中的弱相互作用开始进一步探讨其发生的质子转移反 应，再从体系上扩展到复杂的生物碱基鸟嘌呤分子，采用分子动力学模拟、量 化计算、核磁共振实验等手段对生化模型分子和生物小分子在水溶液中的相互 作用和质子转移反应进行了多角度的研究。 由于生物分子普遍含有羰基，论文首先对最简单的羰基体系丙酮的水溶 液进行了研究。我们采取全原子OPLS．AA力场对该体系进行了分子动力学模拟， 发现羰基侧甲基与水分子间存在着明显的C-H…0弱相互作用，并结合核磁共振 波谱研究了体系中的氢键网络结构；之后引入相对氢键度r7。