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Zhang Xuehai 2015-11-9 Background(背景介绍) 基因突变 主要指DNA核苷酸顺序，种类和数量的改变，是遗传变异的基本来源。 1、自发突变（偶然的复制、转录、修复时的错配）； 2、诱发突变（诱变剂）； 突变为遗传学研究提供突变型，为育种工作提供素材； 突变是生物进化的重要因素。 自发突变受一系列因素的影响、是一系列变化的结果，具有随机性和稀有性（经典认识）。 随着DNA测序技术的突破性进展，使自发突变在基因组中的数量和分布有了精确的估计。确认了自发突变在基因组中不是随机分布的，突变率在突变热点是很高的，而突变热点普遍存在于基因组中。（现在认识），突变热点是如何产生的？ 生物进化的漫长过程中，造成生物多样性的遗传差异是如何产生、积累乃至保留下来的？ Background(背景介绍) Indel诱变假说（Tian et al, 2008 Nature）： 插入/缺失(Indel)两侧的碱基点突变出现的频率较其他区域要高的多； Indel附近的突变率比一般自发突变率高10倍左右； 某一段DNA序列的突变率取决于该序列与Indel的距离，两者有高度负相关；这种负相关关系在各个基因组中都是普通存在的。 基于人、黑猩猩、恒河猴、小鼠、大鼠、果蝇、两个水稻和三个酿酒酵母基因组。 从源头上回答了遗传变异是如何形成的。 经典遗传学：同源染色体对称的等位基因系列； 非对称遗传学：同源染色体间基因的数量和位置是不同的，可能是某些疾病发生、杂种优势、自交退化等产生的遗传基础 Background(背景介绍) 1）自发突变的数量是由Indel的数量和密度所决定，因而基因组各区域的突变率很不相同。但Indel本身是一种点突变，其发生有一定的随机性，因而其诱发的突变也有一定的随机性；自发突变的数量在Indel附近并不稀有，但远离Indel的区域是稀有的。?2）找到了多数自发突变的发生根源，也就是说，生物多样性的最初变异来源，主要是Indel诱导产生的。?3）Indel在编码区间比碱基置换对基因功能的影响大得多，从而更易被自然选择所淘汰，使保守区间的突变率降低。换句话说，自然选择很大程度上是通过对Indel的选择而实现的，自发突变率的高低很大程度上是自然选择的结果。?4）生物通过调节自身变异能力而适应环境的能力，比我们原先想象的要大得多，即突变在进化中的作用很大。 Evidence indicates that mutation rates vary almost 1,000-fold between species, from 10?11 mutations per nucleotide site per generation in some unicellular organisms to approximately 10?8 in primates (灵长类动物) (genome-wide averages). Mutation rates can vary between nucleotide sites and between members of the same species. Why mutations rates vary within genomes ？ Background Conclusion Materials：Arabidopsis, rice and the honey bee ； Method：Parent-offspring sequencing strategy； Conclusion： 1、Mutation rates are higher in heterozygotes and in proximity to crossover events. 2、Mutations occur disproportionately more often in heterozygous than in homozygous domains. 3、Gene clusters under purifying selection (commonly homozygous) and under balancing selection (mainly heterozygous) have low and high mutation rates, respectively. The authors suggest that extremely weak selection on the mutation rate may therefore not be necessary to explain why mutational hot and cold spots might correspo