20122013年课题进展报告20131010解析.pptVIP

任务目标落实情况 2012-2013年的工作目标、任务和工作安排 （1）2012年12月31日：采集转归队列血清标本110例1次；采集治疗 队列血清标本110例5次；采集慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌患者 血清标本110例1次；其中11例转归队列和治疗队患者在首次采血 前分别采集肝组织标本1次。对所有标本进行临床常规检测。 （2）2013年12月31日：对110例转归队列标本采集血清1次，对所有 标本进行临床常规检测。 课题取得的主要研究进展（1） HBV感染者随访转归队列标本的采集： 采集HBV随访转归队列110例血清标本，收集了这些患者的临床资料 和血清标本，并完成了部分临床检测（包括血常规、生化、凝血酶原时 间、甲胎蛋白、HIV抗体、HCV抗体、HBV DNA定量和腹部超声检查）。 课题取得的主要研究进展（2） 课题取得的主要研究进展（3） HBV相关疾病队列标本的采集： 采集慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌患者肝组织标本40例，并收集相关的临床资料和生化检测指标，包括血常规、甲胎蛋白、HBsAg/ HBeAg定量HBVDNA定量和分型、HCV抗体、腹部超声检查。 课题取得的主要研究进展（4） 建立高灵敏度HBV基因分型型特异荧光定量PCR方法 采用小沟结合探针（Minor Groove Binder Probe, MGB）和肽核酸(peptide nucleic acid, PNA)封闭技术来建立高灵敏度HBV基因分型型特异荧光定量PCR检测法，提高检测灵敏度； 运用第二代深度测序技术对HBV基因型混合感染比例进行检测 MGB B型 C型探针标准曲线及特异性验证 课题突破的关键核心技术 课题目标任务、关键技术指标完成情况 支撑条件落实情况-科技资源 支撑条件落实情况-设备设施 培养博士后1名，博士研究生2名，硕士研究生5名。 1名青年骨干教师获传染病国家重点学科资助，出国留学一年。 教育部优秀博士点基金（新教师类）1项 国家自然科学基金面上项目2项 技术平台优化 开展国际合作 经费使用情况 课题标志性成果 已投送论文 存在的问题与建议 HBV队列的临床资料收集还不够全面 存在的问题与建议 完善HBV序列高通量数据处理技术平台 安排专人负责整理和收集临床相关资料 对补充的临床检测结果进行跟踪和及时补充 录入和梳理专用血清标本库数据系统 临床队列资料系统完善 借鉴高复杂度数据处理的技术方法 深入挖掘HBV种群漂移、基因型转换等信息 与临床资料密切配合 找到核苷类似物治疗耐药的重要预测指标 * * 传染病专项课题（子课题）2013年度自查报告 任务名称：乙型肝炎治疗及转归相关新指标 和新试剂的临床意义评价 任务编号：2012Z003-002 任务承担单位：重庆医科大学 HBV治疗队列标本的采集： 入组HBV治疗队列血清标本110例，其中70例患者均完成了第2次随 访， 23例患者完成了第3次随访。已经采集了患者的临床资料和血液标 本，每次随访进行的临床检测包括血常规、生化、凝血酶原时间、甲胎 蛋白、HIV抗体、HCV抗体、HBV DNA定量和腹部超声检查。 第二代测序技术对混合感染检测情况 95%病例含有混合感染 主要以B、C混合为主 混合比例1%只占12% 已发表文章 1. Ai-Long Huang. Comparison of a Novel Real-Time PCR Assay with Sequence Analysis, Reverse Hybridization, and Multiplex PCR for Hepatitis B Virus Type B and C Genotyping. J.Clin. Microbiol. 2011. 2. Ai-Long Huang. Simultaneous Genotyping and Quantification of Hepatitis B Virus for Genotypes B and C by Real-Time PCR Assay. J Clin Microbiol. 2010. 3. Ai-Long Huang. A new strategy for constructing in vitro replication competent 1.3 copies of hepatitis B virus genome. J Virol Methods. 2009. 基于短序列的HBV分型方法研究 深度测序的