化学信息处理分析报告.pptVIP

第二节 化学信息处理 化学信息学 产生的背景 组合化学和高通量筛选，出现了巨大的信息，需要快速收集、存储、分析和处理，随着信息技术向化学领域的渗透，形成了新的交叉学科——化学信息学。 研究内容 化合物信息在计算机中的表示 化合物数据库的建立、使用和管理 化合物相似性、多样性及分子类药性分析 化合物定量构效关系 化学信息学 Chemoinformatics，chemical informatics，Cheminformatics，chemi-informatics 利用计算机信息处理技术对化学分子结构和相关信息进行管理的一种综合性技术和学科 应用化学信息学可促进化学信息的获取、转化与共享 一、化学信息的表示方法 （一）一维结构表示 SMILES（简化分子线性输入系统）编码的基本原则 原子通常以大写元素符号表示（省略氢原子），芳香结构原子则以小写表示。 相邻原子依次排放在一起，单键通常省略，双键和三键分别以“=”和“#”表示，芳香键以“：”表示，也可省略。 分支部分放在括号内，环则打开，并赋予断开键两端的原子以相同的数值。 双键“/”表示顺式，“\”表示反式。 原子顺时针排列用@表示，逆时针排列用@@表示。 举例说明 苯丙氨酸 SLN编码（Sybyl线性标记法）的规则 原子以其元素符号表示，氢原子也要显示； 单键省略，双键、三键和芳香