《高等微生物学》微生物生态学精要.docVIP

第2章 微生物生态学 什么是生态学 现代生态学研究的领域 21世纪生物学将要回答和解决的主要问题 微生物生态系统和微生物生态学 概念 自然界中微生物及其多样性 微生物生态学研究方法 人胃肠道微生态学 人胃肠道微生物菌群的组成 益生菌的分离筛选 极端微生物 分类 嗜热微生物的高温分子适应性 低温的分子适应性 嗜酸环境的分子适应性 嗜碱菌 嗜盐菌的环境适应性 什么是生态学 经典定义（1896年）：生态学是研究生物与环境相互关系的科学； 1923年：生态学是科学的博物馆； 1961年：生态学是对有机体的分布和数量的研究； 1975年：是进化的环境研究； 1990年（马世骏）：生态学是研究生物的生存条件、生物群落与环境系统之间的相互作用的过程及其规律的科学。包括人文科学和自然科学。 1.1几个基本概念 （1）现代生态学的特点是：以生态系统为中心、以时空耦合为主线、以人地关系为基础、以高效和谐为方向、以持续发展为目的、以生态工程为手段、以整体调控为目标。因此，现代生态学研究的问题包括从小到大各个领域与方面。 （2）随着生态学的发展进程以及对生命本质的认识，根据生态学研究的对象不同，可以将生态学不同的分支学科分为三个层次，即宏观生态学、微生态学和分子生态学： 宏观生态学研究生物个体以上层次，包括个体、群体、群落甚至生物区系同其环境关系的科学，包括研究生物与环境、生物与生物之间的相互作用、相互制约有及其功能表达规律。 微生态学是在生物体细胞层次上阐述生物与环境关系的科学。 分子生态学是以生物特征分子（特别是核酸分子）为研究对象，借助现代分子生物学技术从分子水平上来探索和阐述生物与环境、生物与生物之间的相互综合利用、相互制约有及其功能表达规律。 1.2分子生态学研究涉及的范围 （1）生物活性因子或功能分子与环境因子之间的作用是分子生态学的核心 生物活性分子及其环境分子相互综合利用物分子生态调节机制，在各种层次的生命现象中都有普遍性，活性分子只有在其网络以及特定的环境分子中才能发挥作用，才能构成机体的平衡稳定机制。 因此分子生态学的核心就是研究活细胞与环境交流时的住处分子的表达、分配、复制和交流的方式。 （2）细胞信息网是分子生态学的纽带 生态系统的基本特点:是进行物质、能量和信息的流动。即能流、物流和信息流。 （i）生物体内外广泛存在着作用于细胞与生物体的信息物质； （ii）细胞信息物质的生物学功能 2．现代生态研究的领域 生态系统中种群规律的调控 生物生产力的利用和保护 研究人工生物群落的稳定性和提高生产力 环境污染防治加强城市生态系统生态学和人类生态学的研究和建设 3、21世纪生物学将要回答和解决的主要问题有： 能源短缺问题 环境污染问题 防止自然生态系统的萎缩 城市由及废弃物的处理机综合利用的生态工程 生态农业和生态工厂 生命活动密切相关的化学元素、化合物及其生态环境效应与人体健康的关系问题 海洋资源的生态调查、开发利用、保护 地球生态系统 微生物生态系统和微生物生态学 概念 （1）微生物生态系统：是微生物系统及其环境组成的具有一定结构和功能的（ecosystem） 图：微生物生态学各分支系统关系图。（张素琴，《微生物分子生态学》2005年） 自然界中微生物及其多样性 陆生微生物生态系统：此类微生物生态系统主要就是土壤微生物生态系统。 水生微生物生态系统：又可分淡水和海水。 大气微生物生态系统：大气环境不利于微生物的存货，空气中没有固定的微生物种群。 根系微生物生态系统： 肠道（消化道）微生物生态系统： 极端环境微生物生态系统： 活性污泥微生物生态系统：活性污泥是有很多靶氏阴性细菌，G+细菌、丝状真菌。 生物膜微生物生态系统：原生动物，后生动物，有机载体，无机颗粒等组成的复杂结构的共生体系。 4.3 微生物生态学研究中的传统方法 微生物生态学研究策略示意图。 样品的采集、富集培养和微生物纯培养的分离 最大或然值法：测定样品中微生物的数量 活菌计数法  未培养微生物 (viable but non-cultural microbes. VBNC））Fluorescence in situ hybridization, FISH) 荧光原位杂交 FISH技术是一种非放射性原位杂交方法，它采用特殊荧光素标记核酸探针，可在染色体细胞和组织切片标本上进行DNA杂交对检测细胞内DNA或RNA的特定序列存在与否最有效。目前FISH技术在国外已广泛应用于微生物分子生态研究中，并成为评价或诊断废水处理系统微生物群落结构的方法。具有高的灵敏性和快捷性。 原位杂交，（FISH）））’s 斑特异化的抗原运输机制是激发人抗异性免疫的