1108-06HGP进展要点.ppt

遗传病基因克隆重大突破 夏家辉教授实验室 1998年克隆了高频耳聋疾病基因 Nature genetics 1998 volume 20 no.4 2001年上海和北京科学家发现 遗传性乳光牙本质II型基因 （1991） rice genome sequencing begins (October) The Japanese rice genome sequencing effort begins. 又一次成功！ ——水稻基因研究 Science 2002 vol296 no.5545 水稻有46022-55615个基因 Newest result of annotation of the complete genome of rice Oryza sativa L. ssp. japonica cultivar Nipponbare: Conservative estimate based on these loci and an extrapolation suggested that the gene number of rice is ～32,000, which is smaller than previous estimates (～ 50,000). Functions were identified or inferred in 19,969 (70%) of the proteins, and 131 possible npRNAs (including 58 antisense transcripts) were found. (The Rice Annotation Project, Genome ResearchGenome Res. 2007 17: 175-183) What is new? 人肠道微生物的基因目录 A human gut microbial gene catalogue 人体是大约100万亿微生物细胞的宿主， 其中大部分在肠道中 对人的生理和营养及生命非常关键 肠道微生物作用： 帮助人从食物中摄取能量 肠道微生物群落的变化： 与肠道疾病或肥胖症有关。 人肠道微生物的基因目录 国际 “人类小肠元基因组学” (MetaHIT)发现： 人肠道微生物菌落基因组比人类基因组大150倍，这些基因大部分是在不同个体之间共享的。 根据由这些基因所编码的各种不同功能，研究人员就有可能来确定最小的肠道元基因组和最小的肠道细菌基因组。 Nature 464: 7285 4 March 2010 国际人类微生物组联盟（IHMC），由美国国立卫生研究院（NIH）、欧盟委员会，以及中国、日本等9个国家组成。解析人类共生微生物与健康关系 。 人体内有两个基因组： ●从父母遗传的基因组，编码大约2.5万个基因 ●出生后肠道内的多达1000多种的共生微生物，其遗传信息的总和叫“微生物组”，也可称为“元基因组”，它们所编码的基因有100万个以上。 两基因组相互协调、和谐一致，保证人体的健康 人肠道微生物的基因目录 Complete Published Genome Projects: 1217 Bacteria (1013) Archaea (80) Eukarya (124) Bacteria (3984) Archaea (202) Eukarya (1324) On going Genomes ( / Last Update: January 24, 2010) (July) Venter and Claire Fraser of TIGR and Hamilton Smith of Johns Hopkins published the first sequence of a free-living organism, Haemophilus influenzae, 1.8 Mb (Science). （1995） published the sequence of Haemophilus influenzae (流感嗜血杆菌) (March) Celera and academic collaborators sequence the 180-Mb genome of the fruit fly Drosophila melanogaster (left), th