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第一章
1.基因工程:是在分子水平上进行的遗传操作,指将一种或多种生物体(供体)的基因或基因组提取出来,或者人工合成的基因,按照人们的愿望进行严密的设计,经过体外加工重组,转移到另一种生物体(受体)的细胞内,使之能在受体细胞遗传并获得新的遗传性状的技术。
2.基因工程的基本过程为哪些?切—接—转—增—检
① 获得目的基因:从供体细胞分离出基因组DNA,用内切酶将外源DNA切开。——切(同时选择运载目的基因的载体)② 目的基因与载体DNA拼接:用DNA连接酶将含有外源基因的DNA片段接到载体分子上,形成DNA重组分子。 ——接 ③ 重组体分子导入受体细胞:借助于细胞转化手段将DNA重组分子导入受体细胞中。——转
④ 短时间培养转化细胞,以扩增DNA重组分子或使其整合到受体细胞的基因组中。 ——增⑤ 筛选和鉴定转化细胞,获得使外源基因高效稳定表达的基因工程菌或细胞。 ——检
3.哪些基因是真核生物特有的?
① 假基因:核苷酸序列同其相应的正常功能基因基本相同,但却不能合成出功能蛋白质的失活基因。 ② 基因家族:由功能相关的基因成套组合形成 ③重复序列
哪些是原核生物特有的:插入序列。哪些是真核和原核共有的:移动基因、重叠基因
第二章
1. 寄主细胞控制的限制与修饰
宿主控制限制——核酸限制性内切酶
宿主控制修饰——修饰的甲基转移酶
以λ(k)噬菌体侵染E.coli B菌株为例解释寄主控制与修饰的现象。
(简述寄主控制的限制与修饰现象。
大多数细菌的噬菌体侵染都存在着一些功能性障碍。所谓的寄主控制的限制与修饰现象简称(R/M体系)。R/M体系:寄主是由两种酶活性配合完成的
R/M体系的作用:
保护自身的DNA不受限制;
破坏外源DNA使之迅速降解;
2. 简述Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型核酸内切酶的基本特性。
(1)Ⅰ型酶基本特性
① 有内切酶活性和甲基化酶活性——互斥② 需要ATP、SAM(S—腺苷甲硫氨酸)和Mg 2+辅助因子;③ EcoB和EcoK是由三种不同亚基组成。γ多肽链:特异性亚基,识别DNA序列的活性。β多肽链:修饰亚基,具有甲基化酶活性。α多肽链:限制亚基:具有核酸内切酶活性④ 有特定的识别位点⑤ 切割方式:结合在识别位点,以滚环形式沿着DNA分子转位,从距识别位点5 ’一侧几千bp处随机切割分子,无特异性。
Ⅱ型酶:①有内切酶活性和甲基化酶活性——分开反应②能识别专一的核苷酸序列,并在固定位置上切割③识别序列的核苷酸对顺序呈回文结构(那项具有回文结构:识别位点的DNA序列呈双重旋转对称 )④切割可形成两种核苷酸切割末端————粘性末端和平末端。粘性末端定义 :指DNA分子在限制酶作用下形成的具有互补碱基的单链延伸末端结构,能通过互补碱基间配对而重新环化起来。
(3)Ⅲ型酶:① 由两个亚基组成的蛋白质复合物,即同时具有内切酶活性和甲基化酶活性
② 需Mg 2+、ATP、SAM辅助因子③可识别特定碱基顺序,并在这一顺序的3’端24 ~ 26bp处切开DNA,所以它的切割位点也是没有特异性的
4. 同尾酶:指来源不同、识别靶序列不同但产生相同的粘性末端的核酸内切酶。利用同尾酶可使切割位点的选择余地更大。
同裂酶:指来源不同但识别相同靶序列的核酸内切酶。同裂酶进行同样的切割,产生同样的末端。但有些同裂酶对甲基化位点的敏感性不同。
星号活性:同一限制酶当某些反应条件变化时酶的专一性发生改变,即酶切位点专一性改变的活性。包装上标“*”注明。
5.DNA缺口平移、取代反应的概念
DNA缺口平移:在DNA分子的单链缺口上,DNA聚合酶Ⅰ的5’ → 3’核酸外切酶活性和聚合作用可以同时发生。
(概念:当外切酶活性从缺口的5’一侧移去一个5’核苷酸之后,聚合酶作用就会在缺口的3’一侧补上一个新的核苷酸,但PolⅠ不能在3’-OH和5’-P之间形成一个键,随着5’一侧的核苷酸不断移去, 3’一侧的核苷酸又按序列增补,缺口便沿着DNA分子合成的方向移动。)
② 用途:通过DNA缺口转移,制备供核酸分子杂交用的带放射性标记的DNA探针。
取代反应:如果在反应混合物中仅存在一种dNTP,则此酶的3’→5’ 的外切酶活性将从ds DNA的3’端降解,直到互补于该dNTP的碱基出现为止,然后在该位置发生合成和取代反应。
6.各DNA聚合酶的基本特性及其区别;
(1)大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ(PolⅠ)的酶活性
① 5’ → 3’的聚合酶活性:需Mg2+
② 5’ → 3’的外切酶活性:可以从游离的5’-OH末端水解DNA分子(修复作用)
③ 3’ → 5’的外切酶活性(较低):从DNA链的3’-OH末端向5’水解DNA(校对
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