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第3章 氨基酸 氨基酸-蛋白质的构件分子 蛋白质的基本结构单位──氨基酸 一、 氨基酸的结构通式 二、二十种常见的蛋白质氨基酸分类、结构 及三字符号 三、氨基酸的性质 四、氨基酸混合物的分析分离 一、 α-氨基酸的一般结构 ① 与羧基相邻的α-碳原子上都有一个氨基,所以称为α-氨基酸(脯氨酸除外)。 ②只有连在α-碳原子上的R基团是可变的,即各种氨基酸的区别就在于R基的不同。 除R为H(即Gly)外,其余氨基酸的α-碳原子都为不对称碳原子(具有旋光性)。 α-碳原子上带有酸性的羧基和一个碱性的氨基,在一定条件下都可解离,是两性电离。 二、氨基酸的分类 蛋白质氨基酸: 蛋白质中常见的20种氨基酸 稀有的蛋白质氨基酸:蛋白质组成中,除上述20种常见氨基酸外,从少数蛋白质中还分离出一些稀有氨基酸,它们都是相应常见氨基酸的衍生物。如4-羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等。 非蛋白质氨基酸:不参与蛋白质组成,在生物体内呈游离或结合态的氨基酸。 二、氨基酸的分类 根据侧链基团的结构将20中常见氨基酸分为3大类 丝氨酸(Ser, S) 苏氨酸(Thr, T) 半胱氨酸(Cys, C) 甲硫氨酸(Met, M) 根据R-基团的极性,将氨基酸分为两类: 非极性氨基酸 极性不带电荷 带正电荷的R基氨基酸 带负电荷的R基氨基酸 三、氨基酸的性质 两性解离和等电点 重要化学反应 光学性质 氨基酸的兼性离子形式 兼性离子:是指在同一个氨基酸分子上同时带有能解离出质子的-NH3+正离子和能接受质子的-COO-负离子,使同一氨基酸分子带有正、负两种电荷的离子形式。 氨基酸的解离 依照Bronsted-Lowry的酸碱质子理论,氨基酸在水中的两性离子既起酸(质子供体)的作用,又起碱(质子受体)的作用。 在适当的酸碱度时,氨基酸的氨基和羧基的解离度完全相等。此时,[正离子]=[负离子],净电荷为零,在电场中既不向阳极移动,也不向阴极移动,成为两性离子。这时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨基酸的等电点,以pI符号表示。 氨基酸的等电点求法: 以甘氨酸(Gly)为例 根据平衡常数公式可得: pH=pKa+lg[质子受体]/[质子供体] 氨基酸的带电状况与溶液的pH有关。改变pH可以使氨基酸带上正电荷或负电荷,也可使处于兼性离子状态。 当氨基酸完全质子化时(即处于酸性溶液时),再用碱滴定 结论: 氨基酸的等电点相当于该氨基酸的两性离子状态两侧基团pK值之和的一半。 即pI=1/2(pKa1+pKa2) 侧链上有解离基团的氨基酸的pI如何计算? (1)首先氨基酸完全质子化; (2)写出其解离方程式: ①先解离α-COOH, 再解离侧链基团上的COOH; ②再解离α-NH3+, 最后解离侧链基团上的NH3+。 (3)标出各解离步骤的pK值,最后以两性离子状态 两侧基团pK值之和的一半计算其等电点。 例如: (1)Glu的pK1(α-COOH)=2.19, pK2(γ- COOH)=4.25,pK3(α- NH3+)=9.67,计算其pI值。 (2)Lys的pK1(α-COOH)=2.18, pK2(α-NH3+)=8.95,pK3(ε- NH3+)=10.53,计算其pI值。 氨基酸等电点的计算 等电点的应用: 1.氨基酸在等电点时溶解度最小。 2.利用不同氨基酸等电点不同,可利用电泳的方式分离氨基酸。 氨基酸的化学反应 (一)由氨基参加的反应 (二)由羧基参加的反应( 自学 ) (三)由氨基和羧基共同参加的反应 (四)由侧链R基团产生的反应 (一)由氨基参加的反应 1. 与HNO2的反应 2. 酰基化和羟基化反应 3.形成西佛碱反应(自学) 4.脱氨基反应(自学) 1. 与HNO2的反应 2.酰基化和羟基化反应 氨基酸氨基的一个H可被酰基或烃基(包括环烃及其衍生物)取代,这些取代基对氨基酸的氨基有保护作用。 (1)酰基化试剂在多肽和蛋白质的人工合成中被用 作氨基的保护试剂。 酰化试剂:苄氧酰氯、叔丁氧甲酰氯、对-甲苯磺酰氯、 邻苯二甲酸酐 ★丹磺酰氯(DNS-cl,5—二甲基氨基萘-1-磺酰氯)常用于多肽链—NH2末端氨基酸的标记和微量氨基酸的定量测定。 (2) 烃基化反应常用于蛋白质的N端氨基酸分析 A. 与二硝基氟苯的反应 B. 氨基酸与苯异硫氰酸(PITH)的反应 (三)由氨基和羧基共同参加的反应 1. 两性解离 2.与茚三酮的反应 3.形成肽键 4. 离子交换反应 3、成肽反应 4. 离
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