第四章计算机图形化技术在化学中的应用重点解析.pptVIP

第四章：计算机图形化技术在化学中的应用 化学化工领域内涉及图形化技术的领域 分子结构（包括平面结构和三维结构）的绘制 反应机理示意图（包括反应式）绘制 实验流程装置图绘制 生产和工艺流程图绘制 原子和分子微观状态图绘制及显示 化学过程（包括各种分离分析过程）图形化显示 实验数据的图形化制作和显示 讨论:利用计算机技术完成分子结构绘制都可以使用哪些方法？根据资源占用、使用方便、功能全面等角度考虑，分析不同方法的优劣。 常用化学图形化软件种类 分子结构绘制软件 分子模型绘制软件 化工装置和流程绘制软件(CAD) 化学实验装置绘制软件 实验数据处理与显示软件 除了第三条之外，一般把上述软件与化学数据库和电子报表等软件集成为化学办公软件 如何用占用资源最少，记录信息量最大，失真最小的方式描述一个分子结构？ BMP, JPG, GIF, PNG, TIF, PCX, TGA, WMF, EPS等格式各有什么特点？ 分子结构也是一种图形，有什么特点？ 几种常见化学结构文件格式 Molecule files: Each molfile describes a single molecular structure which can contain disjoint fragments. Rgroup files: An RGfile describes a single molecular query with Rgroups. Each RGfile is a combination of Ctabs defining the root molecule and each member of each Rgroup in the query. Reaction files: Each rxnfile contains the structural information for the reactants and products of a single reaction. MDL currently has two types of rxnfiles: the REACCS type and the CPSS-rxnfile written by CPSS programs Structure-data files: An SDfile contains structures and data for any number of molecules. Together with RDfiles, SDfiles are the primary format for large-scale data transfer between MDL databases. Reaction-data files: Similar to SDfiles in concept, the RDfile is a more general format that can include reactions as well as molecules, together with their associated data. RDfiles are used primarily by ISIS and REACCS, MACCS-II can also read and write RDfiles except for the reaction structure information. CPSS reads and writes RDfiles with embedded molfiles and CPSS-rxnfiles. 第一节 化学办公软件 化学办公软件的种类：图形绘制和化学文件制作软件，化学数据库应用软件，分子模型制作与显示软件，图谱分析软件等。 化学办公软件的功能和应用：辅助完成实验报告、课题总结、学术论文、学术著作，学术交流演示材料的制作过程；科学管理和分析处理实验结果和数据。 常见化学办公软件的种类：ISISDraw, ChemOffice, Chemsketch, Chemwindows, DSViewerpro, Alchemy等 分子结构式绘制软件ISISDraw的功能与应用 生产厂家：美国MDL信息系统公司。 流行版本：ISISDraw 1.0, 1.5*, 2.0, 2.2, 2.3，2.4 主要功能：绘制二维和三维分子式、绘制化学反应式、绘制反应机理示意图、简单化学反应装置、简单的曲线图和其他示意图。 软件的大小：1.5版2.1Mb, 2.0版4.8Mb, 2.4版7.4Mb(压缩）. 操作环境：Windows或Mac环境，采用windows资源。 ISISDraw软件的使用 软件的安装： 软件的菜单： 软件绘制工具：