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H7N9禽流感传播研究 ——利用动力学方法 背景 禽流感,全名鸟禽类流行性感冒,是由病毒引起的动物传染病,通常感染鸟类、猪、马、海鸟、鲸和人类。 禽流感病毒,属于甲型流感病毒,分为高、中、低/非致病性三级。至今发现能直接感染人的禽流感病毒亚型有:H5N1、H7N1、H7N2、H7N3、H7N7、H9N2和H7N9亚型。 病毒 病毒入侵宿主细胞的过程: 抗原,是能够刺激机体产生(特异性)免疫应答,并能与免疫应答产物抗体在体内外结合,发生免疫效应(特异性反应)物质。 这一系列过程主要是通过抗原内部的抗原决定簇发生反应的。 甲型流感病毒是根据位于血凝素及神经氨酸酶的抗原性分为若干亚型,血凝素(H)有18个亚型;神经氨酸酶(N)有11个亚型。 参数估计 候鸟迁徙 长三角地区候鸟数量模拟 拟合结果比较 候鸟为传染源 Akaikes information criterion(模型一3个拟合结果比较) 如果人与人之间存在传染 拟合结果比较(模型二) 敏感性分析 广东地区的模拟和预测(模型二) 问题1的研究 模型:多菌株模型、年龄结构模型或反应扩散模型等。 数据:基因序列。 谢谢! 野鸟为传染源 家禽为传染源 采取或得出的参数值 Akaike’s information criterion (AIC) provides a method for measuring model quality and a way of selecting a model that has the best fit to the actual data from a set of models. 三种情况下的ACI准则:166.05 171.9301 207.9001 (残差平方和) (实际数据个数) (估计参数个数) 改进的AIC准则(考虑到小样本): 可见,候鸟为传染源的可能性最大。 当人与人之间的传染率比较小时,结果变化不大。当人与人之间的传染率比较大时,人间病例将会上千上万。那是实际中,人与人之间的传染率到底有多大,目前还不清楚。 模型二:冬季再次出现的主要影响因素 因解决问题的侧重点不同,将以上的模型简化 流程图 其它参数估计 为减少估计的参数,将候鸟、野鸟之间的传染率统一为beta1, 家禽之间的接触率为beta2, 环境对家禽的传染率为beta3,对人的传染率为beta4. 拟合结果及所取参数值 模型二比模型一拟合结果好:参数估计时,模型二传染率划分的比模型一细,估计的参数比较多。 措施比较 可见,部分家禽的扑杀只有在短期内有一定的效果,长期时间内对流感的控制效果不大。在长期关闭交易市场下(传染率降低55%),可以有效地控制流感的传播,但是还是会出现周期性,在第二年的2,3月份会出现病例的高峰。如果消毒措施能够有效地执行,那么可将病例控制在很低的水平下。 寻找周期性的关键因素 红线:实际病例。 绿线:如果不存在关闭交易市场的情况下的疾病流行情况。 可见,即使不存在关闭和重新打开交易市场措施的交替执行,疾病还是会出现周期性。但是可以看出,关闭交易市场可以很有效地控制病例的数目。 关闭交易市场的效果 当长三角地区候鸟的数量为常数,不发生周期性变化(没有迁移)的模拟结果。 红线:实际病例。 绿线:如果不存在关闭交易市场的情况下的疾病流行情况。 可见,此图与前一幅图变化不大。可知,候鸟的周期性迁徙对疾病的到达有一定的影响。但是对于已发地区疾病的流行已没有影响。 候鸟迁徙对疾病的影响 温度的变化对疾病的影响 当长三角地区温度为常数,不发生周期性变化的模拟结果。 红线:实际病例。 绿线:如果不存在关闭交易市场的情况下的疾病流行情况。 紫色:温度为常数,不关闭交易市场。可见,温度变化是流感周期性变化的主要原因。 综上所述,周期性是由温度的变化造成,无法控制。但是,可以通过温度的变化,结合周期性关闭交易市场来对流感进行防控。 参数对累积病例(一年)的敏感性 家禽直接接触传染率,相关系数:0.8509 环境对家禽的传染率,相关系数:0.9461 家禽、环境对人的传染率,相关系数1 消毒率,相关系数-0.8411 扑杀率,相关系数-0.9963 靳 祯 山西大学 复杂系统研究所 H7N9 甲型H7N9流感病毒是一个亚型甲型流感病毒,通常只在鸟类中传播,也从未感染过人。然而2013年在中国的流行已造成了人类的感染。 此病的传染源推测为:携带H7N9禽流感病毒的禽类及其分泌物或排泄物。 传播途径推测为:经呼吸道传播、密切接触感染的禽类及其分泌物或排泄物或经受
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